如何用 CSV 数据制作火山图(2026)
2026/06/18

如何用 CSV 数据制作火山图(2026)

无需编程,上传 CSV 或 Excel 差异表达数据即可制作论文级火山图:设置倍数变化和校正 p 值阈值,自动配色上下调基因并标记重点基因,随后在 SciVis 中继续编辑标注与版式,适合转录组与蛋白组研究者快速出图。

火山图把效应量放在横轴、统计显著性放在纵轴,适合汇总差异表达结果。SciDraw 直接读取结果表生成初稿,后续修改统一在 SciVis 中完成。

火山图生成器

需要准备哪些数据?

每次上传一个 CSV、TSV、TXT、XLSX 或 XLS 文件;Excel 仅读取第一个工作表。一个整洁的长表通常已经足够。建议先查看页面内 6 组示例数据,再按相同结构整理自己的文件。

每行代表一个基因、蛋白或代谢物。至少准备特征名称、log2 倍数变化和校正 p 值;显著性分类列可选。不要把缺失值当作 0。

主要字段: feature, log2_fold_change, adjusted_p_value

步骤 1:选择示例或上传文件

打开 火山图生成器。选择最接近研究问题的示例,或上传自己的数据文件。示例既可以直接生成,也可以下载后作为列结构模板。

步骤 2:生成第一版图表

检查系统识别的列,再生成图表。图表类型由当前工具页预先限定,因此数据会按该科研图形的语义处理。生成后仍要用原始分析结果核对数值与统计标注。

火山图生成器

步骤 3:转到 SciVis 继续编辑

点击“在 SciVis 中继续编辑”。结果会进入 SciVis 工作区,可调整标签、配色、标注、刻度、图例和整体版式,而不是留在工具页内编辑。

生成前后的核对清单

  • 优先使用多重检验校正后的 p 值。
  • 横轴以 0 为中心,并明确倍数变化阈值。
  • 只标注与结论有关的少量特征。
  • 核对点数和显著基因数量是否与分析结果一致。

常见问题

  • 是否需要会 R 或 Python?不需要,上传结构化数据即可生成;统计分析本身仍应使用合适的方法完成。
  • 一个文件够吗?多数场景够用,把分组、序列或亚组放在同一张长表的不同列中。
  • 可以上传 Excel 吗?可以,支持 XLSX 和 XLS,但只读取第一个工作表。

开始制作

从页面内的 6 组示例开始,或上传自己的数据。生成第一版后进入 SciVis 完成修改,并在导出前核对全部数值。

作者

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Davie Chen / SciDraw AI

Researcher

Davie Chen 是 University of Arts in Poznan 动画与跨媒体学院的研究者,研究方向包括生成式 AI 在科学图像、专利插图和论文写作中的辅助应用。SciDraw AI 是这一研究方向延伸出的产品之一。

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