CRISPR-Cas9 的機制說起來簡單得令人錯覺，畫起來卻意外地難：一條 guide RNA、一個 Cas9 核酸酶、一段 PAM 序列、在標的位點的鹼基配對、一個平端雙股斷裂，接著是兩條互相競爭的修復路徑。只要畫錯一個元素——PAM 放在錯的股、切點切在錯的位置——整張圖就會誤導讀者。這篇教學要教你怎麼用一句話、靠 AI 就生出一張乾淨、正確、可直接投稿的 CRISPR-Cas9 機制圖，再透過跟編輯器對話來逐步調整。
讀完這篇教學，你將能夠：
- 用一句提示詞生出一張完整的 CRISPR-Cas9 機制圖。
- 把每個關鍵元素標對：sgRNA（crRNA + tracrRNA）、Cas9、PAM、標的／protospacer，以及平端雙股斷裂（DSB）。
- 並排呈現兩條 DNA 修復路徑——容易出錯的 NHEJ（基因剔除）vs. 精確的 HDR（基因敲入）。
- 把提示詞改寫成鹼基編輯、prime editing 或完整的編輯流程。
- 為手稿、投影片或海報匯出一張可編輯的圖。
把下面任何一段提示詞貼進訊號路徑圖產生器或生物路徑圖產生器，再到 SciDraw AI 編輯器裡調整結果。
CRISPR 圖可重複使用的提示詞範本
好的 CRISPR-Cas9 圖提示詞有四個部分：
- 主題——步驟或變體：標的辨識、切割、修復、鹼基編輯或完整流程。
- 組成與交互作用——什麼結合什麼、切點發生在哪裡。
- 標籤——把你想標的每個分子與位點都命名。
- 風格與版面——「扁平向量、可投稿、由左而右流動、清楚的 DNA 雙螺旋」。
範本：「畫出 CRISPR-Cas9 的 [步驟]，呈現 [組成與交互作用]。標註 [sgRNA、Cas9、PAM、標的位點、DSB、修復路徑]。使用乾淨的扁平向量風格、清楚的 DNA 雙螺旋，由左而右版面。」
可直接複製貼上的 CRISPR-Cas9 機制提示詞
標的辨識與切割
- 畫出 CRISPR-Cas9 機制：一個載有單一 guide RNA（sgRNA）的 Cas9 蛋白掃描雙股 DNA、辨識 PAM 序列、sgRNA 的 spacer 與互補的標的股鹼基配對形成 R-loop，以及兩個核酸酶結構域（RuvC 與 HNH）在 PAM 上游三個鹼基對處製造平端雙股斷裂。標註 Cas9、sgRNA、PAM、protospacer／標的、RuvC、HNH 與切割位點。
- 呈現 sgRNA 的結構：crRNA（spacer + scaffold）與 tracrRNA 融合成單一 guide RNA，並把定義標的的 20 個核苷酸 spacer 標示並反白。
DNA 修復：NHEJ vs. HDR
- 並排畫出 Cas9 雙股斷裂後的兩種 DNA 修復結果：左側為非同源端接合（NHEJ）產生小的插入／缺失與基因剔除，右側為同源導向修復（HDR）利用 donor template 引入精確編輯（基因敲入）。標註 NHEJ、indel、knockout、HDR、donor template 與精確編輯。
變體與流程
- 圖示鹼基編輯：一個催化能力受損的 Cas9（nickase）與一個 deaminase 融合，在不造成雙股斷裂的情況下轉換單一鹼基（C→T 或 A→G）。標註 nCas9、deaminase、sgRNA、標的鹼基與編輯後的鹼基。
- 把 CRISPR-Cas9 基因編輯流程畫成由左而右的流程圖：guide RNA 設計、載體選殖、細胞轉染／遞送、編輯後選殖株篩選、基因型驗證，以及表現型分析。
怎麼得到乾淨、正確的 CRISPR 圖
- 把你想標的每個元素都命名。 列出「sgRNA、Cas9、PAM、protospacer、RuvC、HNH、DSB」。
- 把 PAM 放對位置。 告訴 A：PAM（SpCas9 為 NGG）位於 protospacer 的緊鄰 3′ 端、在非標的股上，切點約在上游 3 bp 處。
- 區分兩條修復路徑。 要求「左側 NHEJ（indel、基因剔除）、右側 HDR（donor template、精確基因敲入）」，讓兩者讀起來是替代方案。
- 讓 DNA 清楚可辨。 要求「清楚、間距均勻的雙螺旋」，讓鹼基配對與切點看得見。
- 迭代，別重來。 用「把切點畫得更清楚」或「把 guide RNA 重新上色」來調整，而不是重寫整段提示詞。
常見錯誤（以及如何修正）
- PAM 放錯股或錯位。 修正：指定「PAM（NGG）位於 protospacer 緊鄰 3′ 端、在非標的股上，切點在上游 3 bp」。
- 切割畫成單股。 Cas9 製造的是雙股斷裂。修正：加上「切斷雙股的平端雙股斷裂」。
- NHEJ 與 HDR 併成一條路徑。 修正：要求兩條清楚分開、結果各異的分支。
- guide RNA 畫成 DNA。 修正：標註為「單一 guide RNA（sgRNA）」，並要求它在視覺上與 DNA 雙螺旋有區別。
- 文字亂碼（一般圖像 AI 的通病）。修正：SciDraw AI 會渲染乾淨的無襯線標籤——必要時把確切措辭重新提示一次即可。
匯出與使用你的 CRISPR 圖
機制看起來對了之後，匯出成可編輯的 SVG 或 PowerPoint（PPTX），或下載高解析度圖檔，用於手稿、投影片或海報。想要更多可改寫的機制提示詞？看我們的訊號路徑圖提示詞。需要修標籤或翻譯？看如何編輯 AI 圖表中的文字與標籤。
常見問題
畫 CRISPR-Cas9 圖最好用的 AI 工具是哪個？ SciDraw AI 的訊號路徑圖產生器與生物路徑圖產生器能產出可投稿的 CRISPR 圖——guide RNA 標的辨識、PAM 辨識、雙股斷裂，以及 NHEJ vs. HDR 修復——標籤乾淨，並可匯出可編輯檔案。
怎麼正確呈現 PAM 與切割位點？ 告訴 AI：PAM（SpCas9 為 NGG）位於 protospacer 緊鄰 3′ 端、在非標的股上，平端切點約在上游 3 bp 處。可以用上面的第 1 段提示詞當起點。
怎麼畫 NHEJ vs. HDR 修復？ 要求兩條並排的分支：NHEJ 產生 indel 與基因剔除，HDR 利用 donor template 進行精確基因敲入。上面的第 3 段提示詞正是這麼做的。
可以免費做 CRISPR 圖嗎？ 可以——你可以免費開始生成 CRISPR-Cas9 機制圖，之後再升級以取得更多點數，以及可編輯的 SVG/PPTX 匯出。
這張 CRISPR 圖夠精確、可以投稿嗎？ 它的設計目標就是可投稿的輸出，但請務必依你的構築（construct）檢視生物學——PAM 位置、切割位點與修復結果——並在投稿前修正任何標籤。
開始創作
挑上面任一段提示詞，貼進訊號路徑圖產生器，再到 SciDraw AI 編輯器裡調整到符合你的實驗。從 guide RNA 標的辨識到精確基因敲入，你的下一張 CRISPR-Cas9 圖只差一句話。
