El volcano plot sitúa el tamaño del efecto en el eje x y la significación en el eje y. SciDraw genera una primera versión desde la tabla de resultados y SciVis se encarga de la edición posterior.
¿Qué datos necesitas?
Sube un solo archivo CSV, TSV, TXT, XLSX o XLS. En Excel se usa la primera hoja. Una tabla limpia en formato largo suele bastar; los seis ejemplos muestran la estructura de columnas.
Cada fila corresponde a un gen, proteína o metabolito. Incluye identificador, cambio log2 y p ajustada; la clase de significación es opcional. No conviertas los valores ausentes en cero.
Columnas principales: feature, log2_fold_change, adjusted_p_value
Paso 1: elige un ejemplo o sube el archivo
Abre el generador de volcano plots. Elige el ejemplo más cercano a tu estudio o sube tu archivo. Los ejemplos pueden generarse directamente o descargarse como plantilla.
Paso 2: genera la primera figura
Revisa las columnas detectadas y genera la figura. El tipo de gráfico queda fijado por la página. Después contrasta valores y anotaciones estadísticas con el análisis original.
Paso 3: continúa editando en SciVis
Pulsa «Continuar editando en SciVis» para abrir el resultado en el espacio SciVis. Allí puedes ajustar etiquetas, colores, anotaciones, escalas, leyenda y composición.
Lista de comprobación
- Usar valores p ajustados por comparaciones múltiples.
- Centrar el eje x en 0 y mostrar los umbrales.
- Etiquetar solo los resultados biológicamente relevantes.
- Comparar el número de puntos y resultados significativos con el análisis.
Preguntas frecuentes
- ¿Necesito R o Python? No, aunque el análisis estadístico debe hacerse con un método adecuado.
- ¿Basta un archivo? Normalmente sí; grupos, series o subgrupos se guardan como columnas de una misma tabla larga.
- ¿Admite Excel? Sí, XLSX y XLS, pero solo se lee la primera hoja.
Empieza a crear
Empieza con uno de los seis ejemplos o con tu archivo. Genera la primera versión, termínala en SciVis y comprueba todos los valores antes de exportar.
