O volcano plot coloca o tamanho do efeito no eixo x e a significância no eixo y. O SciDraw cria a primeira versão diretamente da tabela de resultados e o SciVis recebe as edições seguintes.
Quais dados preparar?
Envie um único arquivo CSV, TSV, TXT, XLSX ou XLS. No Excel, a primeira planilha é usada. Uma tabela limpa em formato longo costuma bastar; os seis exemplos mostram a estrutura esperada.
Cada linha representa um gene, proteína ou metabólito. Inclua identificador, log2 fold change e p ajustado; a classe de significância é opcional. Não transforme ausências em zero.
Colunas principais: feature, log2_fold_change, adjusted_p_value
Etapa 1: escolha um exemplo ou envie o arquivo
Abra o gerador de volcano plot. Escolha o exemplo mais próximo da pesquisa ou envie seu arquivo. Os exemplos podem ser gerados na hora ou baixados como modelo.
Etapa 2: gere a primeira figura
Confira as colunas detectadas e gere a figura. O tipo de gráfico já é definido pela página. Depois compare valores e anotações estatísticas com a análise original.
Etapa 3: continue no SciVis
Ao clicar em “Continuar editando no SciVis”, o resultado abre no espaço SciVis. Ali você ajusta rótulos, cores, anotações, escalas, legenda e layout.
Lista de verificação
- Preferir valores p ajustados para testes múltiplos.
- Centralizar o eixo x em 0 e mostrar os limites.
- Rotular apenas achados biologicamente relevantes.
- Comparar pontos e achados significativos com a análise.
Perguntas frequentes
- Preciso de R ou Python? Não, mas a análise estatística ainda deve usar um método adequado.
- Um arquivo basta? Geralmente sim; grupos, séries ou subgrupos ficam em colunas da mesma tabela longa.
- Excel funciona? Sim, XLSX e XLS, mas apenas a primeira planilha é lida.
Comece a criar
Comece com um dos seis exemplos ou seu arquivo. Gere a primeira versão, finalize no SciVis e confira todos os valores antes de exportar.
