Generador de Manhattan plot gratis
Crea un Manhattan plot de GWAS a partir de texto sencillo
Describe tu estudio de asociación de todo el genoma, los cromosomas que quieres mostrar y los umbrales de significación, y la IA dibuja un Manhattan plot limpio con -log10(p) en el eje y y picos etiquetados, listo para clases de genética, figuras de laboratorio y borradores de artículos.
Ejemplos de Manhattan plot
Haz clic en cualquier ejemplo para cargar su indicación o úsalo como punto de partida para tu propio gráfico GWAS.
¿Qué es un Manhattan plot?
Un Manhattan plot es la figura estándar para resumir un estudio de asociación de todo el genoma (GWAS). Cada punto es una única variante genética (SNP) representada según su posición genómica a lo largo del eje x y según la fuerza de su asociación con un rasgo en el eje y, mostrada como -log10(valor p). Como los cromosomas se disponen uno tras otro con colores alternos en los adyacentes, los grupos de variantes fuertemente asociadas forman picos altos tipo «rascacielos» que recuerdan al perfil de una ciudad, de donde proviene el nombre. SciDraw AI convierte tu descripción de texto en un Manhattan plot limpio con calidad de publicación, para que ilustres la estructura de un GWAS sin escribir R ni Python.
¿Por qué usar un generador de Manhattan plot?
- Consigue un Manhattan plot de GWAS claro en segundos para una charla, una clase o un boceto de figura.
- Muestra la línea de significación de todo el genoma en 5e-8 y una línea sugestiva sin pelearte con el código del gráfico.
- Dispón todos los cromosomas en colores alternos con picos etiquetados, sin necesidad de saber diseño.
- Crea figuras didácticas que expliquen cómo se leen los resultados de un GWAS, los valores p y los loci.
- Esboza rápidamente Miami plots y diseños anotados antes de tener las estadísticas resumidas finales.
Cómo hacer un Manhattan plot
Describe el gráfico en lenguaje sencillo: qué cromosomas abarcar (1-22 y X), hasta dónde debe llegar el eje de -log10(p), si dibujar la línea de significación de todo el genoma en 5e-8 y una línea sugestiva en 1e-5, y qué picos etiquetar con el nombre del gen más cercano. Menciona si quieres un Miami plot que compare dos rasgos o loci concretos resaltados. SciDraw AI dibuja entonces un Manhattan plot limpio con colores alternos de cromosomas y anotaciones ordenadas, y puedes refinar la indicación y regenerar hasta que quede bien.
Partes de un Manhattan plot
- Eje x: posición genómica agrupada por cromosoma (1-22 y X), con los cromosomas adyacentes en colores alternos
- Eje y: -log10(valor p), de modo que las asociaciones más fuertes quedan más arriba en el gráfico
- Línea de significación de todo el genoma: una línea horizontal en p = 5e-8 (-log10 p ~ 7,3)
- Línea sugestiva: una línea inferior opcional en p = 1e-5 que marca señales más débiles
- Picos y loci: grupos de puntos («rascacielos») que se elevan por encima del umbral
- Anotaciones de genes: etiquetas que nombran el gen más cercano en cada locus destacado
Preguntas frecuentes sobre el Manhattan plot
¿Qué es un Manhattan plot?
Un Manhattan plot es la figura estándar de un estudio de asociación de todo el genoma (GWAS). Cada punto es una variante genética situada según su posición a lo largo del genoma en el eje x y según su -log10(valor p) en el eje y. Los cromosomas se dibujan uno tras otro en colores alternos, de modo que las regiones fuertemente asociadas forman picos altos que parecen el perfil de una ciudad: de ahí el nombre de Manhattan plot.
¿Por qué el eje y es -log10(p) y no el valor p en bruto?
Los valores p de un GWAS abarcan muchos órdenes de magnitud, desde casi 1 hasta 1e-50 o menos, así que una escala en bruto aplastaría toda señal relevante contra el eje. Tomar -log10(p) convierte esos valores p diminutos en números positivos grandes: p = 0,01 se convierte en 2, p = 5e-8 en unos 7,3 y p = 1e-20 en 20. Cuanto más fuerte es la asociación, más alto queda el punto, que es justo lo que hace legibles los picos.
¿Qué es el umbral de significación de todo el genoma de 5e-8 y por qué ese valor?
El umbral de significación de todo el genoma es p = 5e-8, dibujado como una línea horizontal en un -log10 p de unos 7,3. Proviene de una corrección de tipo Bonferroni para contrastar aproximadamente un millón de variantes comunes independientes en el genoma (0,05 / 1.000.000 = 5e-8). Las variantes cuyos picos cruzan esta línea se suelen reportar como significativas a nivel de todo el genoma, mientras que una línea sugestiva más laxa en 1e-5 marca señales candidatas más débiles que merecen seguimiento.
¿Cuál es la diferencia entre un Manhattan plot y un QQ plot en GWAS?
Un Manhattan plot muestra dónde caen las asociaciones a lo largo del genoma y cómo de fuertes son, de modo que puedas leer qué loci son significativos. Un QQ plot, en cambio, comprueba toda la distribución de los estadísticos de contraste: representa los -log10(p) observados frente a los valores esperados bajo la hipótesis de no asociación. Los dos son complementarios: el QQ plot diagnostica inflación o confusión en todo el estudio, mientras que el Manhattan plot muestra los loci concretos.
¿El generador de Manhattan plot es gratis?
Cada generación consume un pequeño número de créditos. Las cuentas nuevas reciben créditos gratuitos para empezar, así que puedes crear Manhattan plots de inmediato, con planes de pago disponibles si necesitas generar muchas figuras de GWAS de forma habitual.
¿Puedo usar estos gráficos para publicaciones o investigación real?
Las figuras de SciDraw AI son ilustrativas: son ideales para docencia, diapositivas, pósteres y bocetos de diseño, pero se dibujan a partir de tu descripción, no de datos reales. Para un resultado de GWAS real debes representar tus propias estadísticas resumidas (posiciones y valores p por SNP) con una herramienta como R o Python, de modo que cada punto y cada pico reflejen el análisis real.
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