Referenz für die Notation wissenschaftlicher Diagramme
Wenn Sie ein Signalweg- oder Mechanismusdiagramm zeichnen, trägt der gewählte Pfeil Bedeutung: eine spitze Pfeilspitze steht für Aktivierung, ein flacher T-Balken für Hemmung, ein offener Kreis für Katalyse. Diese Seite zeigt die korrekte Glyphe für jede Beziehung und sagt Ihnen, welche Symbole durch einen formalen, zitierfähigen Standard gedeckt sind und welche lediglich einer weit verbreiteten Konvention folgen.
SBGN-Process-Description-Kanten (formaler Standard)
Die Sprache Process Description der Systems Biology Graphical Notation (SBGN) definiert präzise Linienendformen dafür, wie eine Entität auf einen Prozess einwirkt. Dies sind die kanonischen Formen; die Glyphen unten sind so gezeichnet, dass sie dem offiziellen SBGN-PD-Level-1-Benutzerhandbuch entsprechen.
| Glyphe | Kante | Bedeutung | Linienende (gemäß SBGN-PD-Handbuch) |
|---|---|---|---|
| Verbrauch | Ein Edukt wird von einem Prozess verbraucht | Eine einfache Linie ohne Symbol am Ende | |
| Produktion | Ein Prozess erzeugt ein Produkt | Eine ausgefüllte (massive) Pfeilspitze | |
| Stimulation / Aktivierung | Wirkt positiv auf den Fluss eines Prozesses | Eine leere (nicht ausgefüllte) Pfeilspitze | |
| Katalyse | Ein Sonderfall der Stimulation (ein Enzym katalysiert einen Prozess) | Ein leerer Kreis | |
| Inhibition | Wirkt negativ auf den Fluss eines Prozesses | Ein Balken senkrecht zur Kante (T-Balken) | |
| Modulation | Wirkt auf den Fluss, ohne ein positives oder negatives Vorzeichen anzugeben | Eine leere Raute | |
| Notwendige Stimulation | Stimulation, die für das Eintreten des Prozesses erforderlich ist | Ein Balken, gefolgt von einer offenen Pfeilspitze |
Notationsstandards & Konventionen
Welche Systeme formale, versionierte Standards sind und welche Konventionen. Formale Standards haben eine offizielle Spezifikation, die Sie zitieren können; Konventionen sind weit verbreitet, aber nicht standardisiert.
Mechanistische, zeitlich geordnete biochemische Prozesse — am nächsten an den Stoffwechsel- und Regulationswegen in Lehrbüchern. Definiert Prozessknoten und neun Kanten.
Gepflegt von: SBGN-Community (unter COMBINE) · Level 1 (current PD version, successor to V2.0 2019 / V1.3 2015)
Alle Beziehungen, an denen eine Entität beteiligt ist, unabhängig von zeitlichen Aspekten. (Einzelne ER-Glyphenformen werden hier nicht wiedergegeben — siehe die offizielle Spezifikation.)
Gepflegt von: SBGN-Community (unter COMBINE) · Level 1 Version 2.0 (2015)
Fluss von Information und Einfluss zwischen biochemischen Entitäten — nützlich für Störungseffekte. (Einzelne AF-Glyphenformen werden hier nicht wiedergegeben — siehe die offizielle Spezifikation.)
Gepflegt von: SBGN-Community (unter COMBINE) · Level 1 Version 1.2 (2015)
Spitze Pfeilspitze = Aktivierung, flacher Balken/T-Balken = Inhibition. Formalisiert, sobald eine Abbildung SBGN deklariert; in einer einfachen molekularbiologischen Abbildung ist es eine geteilte Konvention, kein Standard.
Gepflegt von: Gängige Praxis (nur innerhalb von SBGN formalisiert) · N/A
Fluss der Teilnehmenden durch eine randomisierte kontrollierte Studie in vier Phasen: Einschluss → Zuteilung → Nachbeobachtung → Analyse, mit Erfassung der Anzahlen und Ausschlüsse an jedem Übergang.
Gepflegt von: CONSORT Group · CONSORT 2025 (updates 2001, 2010)
Internationale Norm für Symbole in elektrotechnischen und elektronischen Schaltplänen. Verwendet in Europa, China, Australien und weiten Teilen Asiens.
Gepflegt von: International Electrotechnical Commission (IEC) · Maintained symbol database (~1,900 symbols)
Nordamerikanische Schaltplansymbole und Kennbuchstaben für Betriebsmittel. Weitgehend kompatibel zu IEC gehalten, wobei einige Bauteilformen abweichen.
Gepflegt von: IEEE · IEEE 315 (Inactive-Reserved since 7 Nov 2019)
Häufig gestellte Fragen
Wie sollten Aktivierung und Hemmung dargestellt werden?
In SBGN endet Stimulation/Aktivierung in einer leeren (ungefüllten) Pfeilspitze und Hemmung in einem Balken senkrecht zur Linie (einem T-Balken). Außerhalb von SBGN ist dieselbe Paarung eher eine gängige Konvention als ein vorgeschriebener Standard, aber wenn Sie ihr folgen, bleibt Ihre Abbildung ohne Legende lesbar.
Ist SBGN für Signalweg-Abbildungen erforderlich?
Nein — SBGN ist optional. Es ist ein formaler Standard, den Sie übernehmen können, um eine Signalweg- oder Mechanismus-Abbildung eindeutig zu machen, mit drei Sprachen (Process Description, Entity Relationship, Activity Flow). Viele veröffentlichte Abbildungen verwenden SBGN-ähnliche Konventionen, ohne der Spezifikation formal zu folgen.
Welcher Standard regelt Schaltkreis- oder Studienfluss-Diagramme?
Schaltkreissymbole sind durch IEC 60617 (international) und IEEE/ANSI 315 (Nordamerika, jetzt inaktiv-reserviert) standardisiert. Der Teilnehmerfluss randomisierter Studien folgt dem CONSORT-Flussdiagramm — einem formalen Berichtsstandard mit vier Phasen: Einschluss (Enrollment), Zuteilung (Allocation), Nachbeobachtung (Follow-Up), Analyse (Analysis).
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