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免费曼哈顿图生成器

用纯文字描述即可生成 GWAS 曼哈顿图

描述你的全基因组关联研究、需要展示的染色体以及显著性阈值,AI 即可绘制干净的曼哈顿图,y 轴为 -log10(p),并标注峰值——适用于遗传学讲座、实验室配图和论文初稿。

文字描述即可生成 GWAS 曼哈顿图5e-8 处的全基因组显著性线染色体交替配色与基因标注无需编程或汇总统计文件

AI 曼哈顿图生成器

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AI 曼哈顿图生成器示例

这是示例结果。描述你的内容,生成你自己的。

曼哈顿图示例

点击任意示例加载其提示语,或将其作为自定义 GWAS 图的起点。

什么是曼哈顿图?

曼哈顿图是用于汇总全基因组关联研究(GWAS)的标准图。每个点代表一个遗传变异(SNP),其 x 轴位置为基因组上的位置,y 轴为该变异与某一性状关联强度,即 -log10(p 值)。由于染色体首尾相接排列、相邻染色体采用交替配色,强关联变异聚集形成高耸的「摩天楼」峰值,整体酷似城市天际线——这正是其名称的由来。SciDraw AI 会把你的文字描述转化为干净、出版风格的曼哈顿图,让你无需编写 R 或 Python 即可展示 GWAS 布局。

为什么要用曼哈顿图生成器?

  • 几秒钟即可得到清晰的 GWAS 曼哈顿图,用于演讲、讲座或配图草图。
  • 无需折腾绘图代码,即可画出 5e-8 的全基因组显著性线和提示线。
  • 无需设计技巧,也能将所有染色体以交替配色排布并标注峰值。
  • 制作讲解 GWAS 结果、p 值与位点读法的教学图。
  • 在拿到最终汇总统计之前,快速草拟 Miami 图和带注释的布局。

如何制作曼哈顿图

用通俗语言描述:要涵盖哪些染色体(1-22 及 X)、-log10(p) 轴最高到多少、是否在 5e-8 处画全基因组显著性线、是否在 1e-5 处画提示线,以及要为哪些峰值标注最近基因名。如需比较两个性状的 Miami 图或高亮特定位点也请说明。SciDraw AI 随后会绘制一张染色体交替配色、注释整齐的曼哈顿图,你还可以修改提示词并重新生成,直到满意为止。

曼哈顿图的组成部分

  • x 轴:按染色体(1-22 及 X)分组的基因组位置,相邻染色体交替配色
  • y 轴:-log10(p 值),关联越强的点位置越高
  • 全基因组显著性线:p = 5e-8 处的水平线(-log10 p 约 7.3)
  • 提示线:可选的较低水平线,位于 p = 1e-5,标记较弱信号
  • 峰值与位点:高出阈值线的「摩天楼」式点簇
  • 基因注释:在每个顶部位点标注最近基因名称的标签

曼哈顿图常见问题

什么是曼哈顿图?

曼哈顿图是全基因组关联研究(GWAS)的标准图。每个点是一个遗传变异,x 轴为其在基因组上的位置,y 轴为其 -log10(p 值)。染色体首尾相接、采用交替配色,因此强关联区域会形成高耸的峰值,看上去像城市天际线——「曼哈顿」图由此得名。

为什么 y 轴用 -log10(p) 而不是原始 p 值?

GWAS 的 p 值跨越很多个数量级,从接近 1 一直到 1e-50 甚至更小,若用原始刻度,所有有意义的信号都会被压在坐标轴附近。取 -log10(p) 可将这些极小的 p 值转换为较大的正数:p = 0.01 变为 2,p = 5e-8 约为 7.3,p = 1e-20 变为 20。关联越强,点越高,峰值因而清晰可读。

5e-8 的全基因组显著性阈值是什么,为什么是这个值?

全基因组显著性阈值为 p = 5e-8,画作 -log10 p 约 7.3 处的水平线。它来自对全基因组约一百万个独立常见变异检验的 Bonferroni 式校正(0.05 / 1,000,000 = 5e-8)。峰值越过这条线的变异通常被报告为全基因组显著,而较宽松的 1e-5 提示线则标记值得跟进的较弱候选信号。

曼哈顿图和 GWAS 中的 QQ 图有什么区别?

曼哈顿图展示关联沿基因组分布的位置及强度,让你读出哪些位点显著。QQ 图则检查整套检验统计量的分布:将观测到的 -log10(p) 与无关联假设下的期望值作图。两者互补——QQ 图诊断全研究层面的膨胀或混杂,曼哈顿图则呈现具体的位点。

曼哈顿图生成器免费吗?

每次生成会消耗少量额度。新账号会获得免费额度,让你立即开始制作曼哈顿图;如果你需要经常生成大量 GWAS 图,也提供付费套餐。

这些图可以用于发表或真实研究吗?

SciDraw AI 生成的图是示意性的——非常适合教学、幻灯片、海报和布局草图,但它们依据你的描述绘制,而非真实数据。要得到真正的 GWAS 结果,你必须用 R 或 Python 等工具绘制自己的汇总统计(各 SNP 的位置与 p 值),使每个点和峰值都反映真实分析。

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立即绘制你的曼哈顿图

描述你的 GWAS 布局、显著性线和峰值,几秒钟即可得到一张干净的全基因组关联图。使用 SciDraw AI 免费开始。

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