免费曼哈顿图生成器
用纯文字描述即可生成 GWAS 曼哈顿图
描述你的全基因组关联研究、需要展示的染色体以及显著性阈值,AI 即可绘制干净的曼哈顿图,y 轴为 -log10(p),并标注峰值——适用于遗传学讲座、实验室配图和论文初稿。
AI 曼哈顿图生成器
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示例这是示例结果。描述你的内容,生成你自己的。
曼哈顿图示例
点击任意示例加载其提示语,或将其作为自定义 GWAS 图的起点。
什么是曼哈顿图?
曼哈顿图是用于汇总全基因组关联研究(GWAS)的标准图。每个点代表一个遗传变异(SNP),其 x 轴位置为基因组上的位置,y 轴为该变异与某一性状关联强度,即 -log10(p 值)。由于染色体首尾相接排列、相邻染色体采用交替配色,强关联变异聚集形成高耸的「摩天楼」峰值,整体酷似城市天际线——这正是其名称的由来。SciDraw AI 会把你的文字描述转化为干净、出版风格的曼哈顿图,让你无需编写 R 或 Python 即可展示 GWAS 布局。
为什么要用曼哈顿图生成器?
- 几秒钟即可得到清晰的 GWAS 曼哈顿图,用于演讲、讲座或配图草图。
- 无需折腾绘图代码,即可画出 5e-8 的全基因组显著性线和提示线。
- 无需设计技巧,也能将所有染色体以交替配色排布并标注峰值。
- 制作讲解 GWAS 结果、p 值与位点读法的教学图。
- 在拿到最终汇总统计之前,快速草拟 Miami 图和带注释的布局。
如何制作曼哈顿图
用通俗语言描述:要涵盖哪些染色体(1-22 及 X)、-log10(p) 轴最高到多少、是否在 5e-8 处画全基因组显著性线、是否在 1e-5 处画提示线,以及要为哪些峰值标注最近基因名。如需比较两个性状的 Miami 图或高亮特定位点也请说明。SciDraw AI 随后会绘制一张染色体交替配色、注释整齐的曼哈顿图,你还可以修改提示词并重新生成,直到满意为止。
曼哈顿图的组成部分
- x 轴:按染色体(1-22 及 X)分组的基因组位置,相邻染色体交替配色
- y 轴:-log10(p 值),关联越强的点位置越高
- 全基因组显著性线:p = 5e-8 处的水平线(-log10 p 约 7.3)
- 提示线:可选的较低水平线,位于 p = 1e-5,标记较弱信号
- 峰值与位点:高出阈值线的「摩天楼」式点簇
- 基因注释:在每个顶部位点标注最近基因名称的标签
曼哈顿图常见问题
什么是曼哈顿图?
曼哈顿图是全基因组关联研究(GWAS)的标准图。每个点是一个遗传变异,x 轴为其在基因组上的位置,y 轴为其 -log10(p 值)。染色体首尾相接、采用交替配色,因此强关联区域会形成高耸的峰值,看上去像城市天际线——「曼哈顿」图由此得名。
为什么 y 轴用 -log10(p) 而不是原始 p 值?
GWAS 的 p 值跨越很多个数量级,从接近 1 一直到 1e-50 甚至更小,若用原始刻度,所有有意义的信号都会被压在坐标轴附近。取 -log10(p) 可将这些极小的 p 值转换为较大的正数:p = 0.01 变为 2,p = 5e-8 约为 7.3,p = 1e-20 变为 20。关联越强,点越高,峰值因而清晰可读。
5e-8 的全基因组显著性阈值是什么,为什么是这个值?
全基因组显著性阈值为 p = 5e-8,画作 -log10 p 约 7.3 处的水平线。它来自对全基因组约一百万个独立常见变异检验的 Bonferroni 式校正(0.05 / 1,000,000 = 5e-8)。峰值越过这条线的变异通常被报告为全基因组显著,而较宽松的 1e-5 提示线则标记值得跟进的较弱候选信号。
曼哈顿图和 GWAS 中的 QQ 图有什么区别?
曼哈顿图展示关联沿基因组分布的位置及强度,让你读出哪些位点显著。QQ 图则检查整套检验统计量的分布:将观测到的 -log10(p) 与无关联假设下的期望值作图。两者互补——QQ 图诊断全研究层面的膨胀或混杂,曼哈顿图则呈现具体的位点。
曼哈顿图生成器免费吗?
每次生成会消耗少量额度。新账号会获得免费额度,让你立即开始制作曼哈顿图;如果你需要经常生成大量 GWAS 图,也提供付费套餐。
这些图可以用于发表或真实研究吗?
SciDraw AI 生成的图是示意性的——非常适合教学、幻灯片、海报和布局草图,但它们依据你的描述绘制,而非真实数据。要得到真正的 GWAS 结果,你必须用 R 或 Python 等工具绘制自己的汇总统计(各 SNP 的位置与 p 值),使每个点和峰值都反映真实分析。


