火山圖產生器
用實驗或研究資料建立 火山圖產生器
使用火山圖產生器處理 CSV 或 Excel 資料，適合RNA-seq 差異表現、蛋白質體豐度等情境。Python 產生首版圖表，再到 SciVis 調整標註、樣式與匯出。
為研究資料設計可在 SciVis 編輯支援 CSV、TSV、TXT 與 Excel適合論文輸出
火山圖產生器範例與可下載資料
開啟範例即可查看圖表、下載對應 CSV，或將同一份資料載入上方產生器。
火山圖產生器適合呈現什麼？
火山圖產生器把結構化研究資料轉成此圖表最適合表達的統計關係，可用於RNA-seq 差異表現、蛋白質體豐度及相近分析。Python 負責產生可重現的首版圖表，SciVis 用於後續視覺調整。
火山圖產生器需要什麼資料？
- 範例欄位：feature, log2_fold_change, p_value, adjusted_p_value, significance。
- 每列保留一筆觀測、類別、時間點或有效配對。
- 測量值請使用純數字，單位寫在欄名中。
- 空白儲存格視為遺漏值，上傳前請移除彙總列與備註。
火山圖產生器的研究應用範例
- RNA-seq 差異表現
- 蛋白質體豐度
- 單細胞標誌基因
- 代謝體學
- 臨床生物標記
- 自訂閾值
為什麼用火山圖產生器處理研究資料？
- 先以頁面附帶的RNA-seq 差異表現範例核對欄位對應，再替換成自己的數值。
- 把蛋白質體豐度的視覺結構套用到同類資料，維持一致的圖表表達。
- 使用 Python 繪圖流程，不必自行撰寫或除錯繪圖程式。
- 保留產生的數值，在 SciVis 中繼續調整標籤、配色與匯出。
如何使用 火山圖產生器
選擇範例，或上傳一個 CSV、TSV、TXT、XLSX、XLS 檔案；檢查辨識出的欄位，產生圖表，再進入 SciVis 編輯。Excel 僅匯入第一個工作表。
清楚的火山圖產生器應包含什麼？
- 依照 feature, log2_fold_change, p_value, adjusted_p_value, significance 一致對應座標軸、群組或節點。
- 標題清楚說明火山圖產生器呈現的指標或比較。
- 依統計方法需要提供清楚的標籤、單位、圖例與參考線。
- 使用節制的配色，並保留論文、海報或簡報所需解析度。
火山圖產生器還是MA 圖生成器？
當資料欄位與研究問題符合此圖的統計結構時使用火山圖產生器；若重點是另一種比較關係，則選擇MA 圖生成器。分開使用兩類圖表可避免不恰當的視覺編碼。
火山圖產生器 常見問題
火山圖產生器需要哪些資料欄位？
頁面附帶的 CSV 顯示建議結構，代表性欄位為 feature, log2_fold_change, p_value, adjusted_p_value, significance；只要欄位角色相同，也可使用其他名稱。
何時該用火山圖產生器而不是MA 圖生成器？
需要呈現火山圖產生器專門編碼的統計關係時選擇它；若另一種比較更符合研究問題，則選擇MA 圖生成器。
用 火山圖產生器 產生後還能繼續編輯嗎？
可以。用 火山圖產生器 產生後開啟 SciVis，即可修改標籤、配色、註解、版面與其他視覺設定。
火山圖產生器 的圖可以用於論文嗎？
可以。火山圖產生器 以清楚、適合發表的科學圖表為目標；投稿前仍應核對資料與期刊要求。
火山圖產生器 可以輸出高解析度圖嗎？
可以。火山圖產生器 圖在 SciVis 完成編輯後，可依論文、海報、投影片與報告用途輸出。
使用 火山圖產生器 需要會寫程式嗎？
不需要。火山圖產生器 透過引導式上傳流程建立初稿，後續可用 SciVis 的視覺控制細修。
