火山圖產生器
把差異表現資料變成可投稿的圖
描述你的 RNA-seq、蛋白質體或差異表現結果,AI 即可繪製清晰的火山圖——帶顯著性閾值、上調與下調基因配色、關鍵基因標註,可直接用於論文與報告。
火山圖範例
點選任一範例載入其提示詞,或以此為起點製作你自己的火山圖。
這個火山圖產生器能做什麼?
它把你對差異表現結果的描述轉成一張清晰、帶標註的火山圖——橫軸是 log2 fold change,縱軸是統計顯著性(−log10 p 值)。你描述比較的組別、閾值與想突顯的基因,AI 就畫好散點、虛線閾值與標籤,讓顯著上調與下調的特徵一眼可見,不需撰寫繪圖程式碼或手動標註。
為什麼要用火山圖產生器
- 火山圖是以單一張圖呈現差異表現的標準方式。
- 用 R 或 Python 寫出精美、帶標註的圖需要時間和反覆調整。
- fold change 與顯著性閾值讓重要的命中結果對讀者一目了然。
- 研究人員需要快速取得可用於論文、海報與報告的清晰圖。
- 從描述重新產生,比每次更動標籤或截斷值都要重跑腳本快得多。
如何製作火山圖
描述你的比較組別(例如處理組 vs 對照組),指定座標軸與單位——log2 fold change 對 −log10 p 值或校正 p 值——並設定閾值,例如 |log2FC| > 1 且 padj < 0.05。說明要標註哪些基因或蛋白、上下調如何配色。產生圖後,檢查閾值、配色與標籤,反覆調整直到與資料相符。
火山圖的組成
- 橫軸——log2 fold change(效應大小與方向)。
- 縱軸——−log10 p 值或校正 p 值(顯著性)。
- 閾值線——fold change 與顯著性的虛線截斷。
- 上調點——fold change 為正的顯著特徵。
- 下調點——fold change 為負的顯著特徵。
- 基因標籤——最顯著或選定特徵的名稱。
火山圖產生器常見問題
什麼是火山圖?
火山圖是一種用來呈現差異表現的散佈圖。橫軸為 log2 fold change,縱軸為統計顯著性(−log10 p 值),因此變化最大、最顯著的特徵會出現在左上與右上角。
製作火山圖需要哪些資料?
每個特徵(基因、蛋白或代謝物)需要一個 fold change(通常為 log2)以及一個 p 值或校正 p 值。把這些連同閾值一併描述出來,也可以指定想標註的特定特徵。
可以標註特定基因嗎?
可以。在描述裡寫出想標註的基因或蛋白,產生器就會以高亮標示並標註它們;你也可以要求標註最顯著的前 N 個特徵。
可以使用校正後的 p 值嗎?
可以。你可以指定縱軸使用校正 p 值(如 FDR 或 padj),並在提示詞裡設定顯著性截斷值,例如 padj < 0.05。
適合 RNA-seq 與蛋白質體嗎?
適合。同樣的火山圖格式適用於 RNA-seq、蛋白質體、單細胞標誌基因比較、代謝體學等差異豐度分析——只要描述資料與閾值即可。
可以匯出可編輯的圖嗎?
SciDraw AI 可以匯出向量格式,方便你之後調整標籤、配色與閾值。投稿前請務必對照原始資料核對圖形。


