Gerador de Manhattan Plot Grátis
Crie um Manhattan plot de GWAS a partir de texto simples
Descreva seu estudo de associação de genoma completo, os cromossomos a exibir e os limiares de significância que deseja, e a IA desenha um Manhattan plot limpo com -log10(p) no eixo y e picos rotulados — pronto para aulas de genética, figuras de laboratório e rascunhos de artigos.
Exemplos de Manhattan plot
Clique em qualquer exemplo para carregar seu prompt ou use-o como ponto de partida para o seu próprio gráfico de GWAS.
O que é um Manhattan plot?
Um Manhattan plot é a figura padrão para resumir um estudo de associação de genoma completo (GWAS). Cada ponto é uma variante genética individual (SNP) plotada por sua posição genômica ao longo do eixo x e pela força de sua associação com um traço no eixo y, mostrada como -log10(valor p). Como os cromossomos são dispostos um após o outro com os adjacentes em cores alternadas, agrupamentos de variantes fortemente associadas formam picos altos em forma de 'arranha-céu' que lembram a silhueta de uma cidade — daí o nome. O SciDraw AI transforma sua descrição em texto em um Manhattan plot limpo, em estilo de publicação, para que você possa ilustrar um layout de GWAS sem escrever R ou Python.
Por que usar um gerador de Manhattan plot?
- Obtenha um Manhattan plot de GWAS claro em segundos para uma palestra, aula ou esboço de figura.
- Mostre a linha de significância de genoma completo em 5e-8 e uma linha sugestiva sem mexer em código de plotagem.
- Disponha todos os cromossomos em cores alternadas com picos rotulados, sem necessidade de habilidades de design.
- Crie figuras didáticas que expliquem como ler resultados de GWAS, valores p e loci.
- Rascunhe rapidamente Miami plots e layouts anotados antes de ter as estatísticas resumidas finais.
Como fazer um Manhattan plot
Descreva o gráfico em linguagem simples: quais cromossomos abranger (1-22 e X), até onde o eixo de -log10(p) deve ir, se deve desenhar a linha de significância de genoma completo em 5e-8 e uma linha sugestiva em 1e-5, e quais picos rotular com o nome do gene mais próximo. Mencione se deseja um Miami plot comparando dois traços ou loci específicos destacados. O SciDraw AI então desenha um Manhattan plot limpo com cores alternadas de cromossomos e anotações organizadas, e você pode refinar o prompt e regenerar até ficar do jeito certo.
Partes de um Manhattan plot
- Eixo x: posição genômica agrupada por cromossomo (1-22 e X), com cromossomos adjacentes em cores alternadas
- Eixo y: -log10(valor p), de modo que as associações mais fortes ficam mais altas no gráfico
- Linha de significância de genoma completo: uma linha horizontal em p = 5e-8 (-log10 p ~ 7,3)
- Linha sugestiva: uma linha opcional mais baixa em p = 1e-5 marcando sinais mais fracos
- Picos e loci: agrupamentos de pontos ('arranha-céus') que sobem acima do limiar
- Anotações de genes: rótulos com o nome do gene mais próximo em cada locus de topo
Perguntas Frequentes sobre Manhattan Plot
O que é um Manhattan plot?
Um Manhattan plot é a figura padrão para um estudo de associação de genoma completo (GWAS). Cada ponto é uma variante genética posicionada por sua posição ao longo do genoma no eixo x e por seu -log10(valor p) no eixo y. Os cromossomos são desenhados um após o outro em cores alternadas, de modo que regiões fortemente associadas formam picos altos que lembram a silhueta de uma cidade — daí o nome 'Manhattan' plot.
Por que o eixo y é -log10(p) em vez do valor p bruto?
Os valores p de GWAS abrangem muitas ordens de magnitude, de perto de 1 até 1e-50 ou menos, então uma escala bruta esmagaria todo sinal relevante contra o eixo. Tomar -log10(p) transforma esses valores p minúsculos em números positivos grandes: p = 0,01 vira 2, p = 5e-8 vira cerca de 7,3 e p = 1e-20 vira 20. Quanto mais forte a associação, mais alto o ponto, que é exatamente o que torna os picos legíveis.
O que é o limiar de significância de genoma completo de 5e-8 e por que esse valor?
O limiar de significância de genoma completo é p = 5e-8, desenhado como uma linha horizontal em -log10 p de cerca de 7,3. Ele vem de uma correção do tipo Bonferroni para o teste de aproximadamente um milhão de variantes comuns independentes em todo o genoma (0,05 / 1.000.000 = 5e-8). Variantes cujos picos cruzam essa linha geralmente são relatadas como significativas em escala genômica, enquanto uma linha sugestiva mais frouxa em 1e-5 sinaliza sinais candidatos mais fracos que merecem acompanhamento.
Qual é a diferença entre um Manhattan plot e um QQ plot em GWAS?
Um Manhattan plot mostra onde as associações caem ao longo do genoma e quão fortes são, então você pode ler quais loci são significativos. Um QQ plot, em vez disso, verifica toda a distribuição das estatísticas de teste: ele plota o -log10(p) observado contra os valores esperados na ausência de associação. Os dois são complementares — o QQ plot diagnostica inflação ou confundimento ao longo do estudo, enquanto o Manhattan plot mostra os loci específicos.
O gerador de Manhattan plot é grátis?
Cada geração usa um pequeno número de créditos. Contas novas recebem créditos gratuitos para começar, então você pode fazer Manhattan plots imediatamente, com planos pagos disponíveis caso precise gerar muitas figuras de GWAS regularmente.
Posso usar esses gráficos para publicação ou pesquisa real?
As figuras do SciDraw AI são ilustrativas — são ótimas para ensino, slides, pôsteres e esboços de layout, mas são desenhadas a partir da sua descrição, não de dados reais. Para um resultado de GWAS real, você deve plotar suas próprias estatísticas resumidas (posições e valores p por SNP) com uma ferramenta como R ou Python, para que cada ponto e pico reflita a análise real.
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