無料系統樹メーカー
平文からラベル付き進化系統樹を生成
生物種・遺伝子・配列とその関係性を記述すると、AIが進化の歴史を示すきれいでラベル付きの系統樹を描画します。研究論文・プレゼンテーション・生物学の授業にすぐ使えます。
系統樹の例
例をクリックするとプロンプトが読み込まれます。自分の進化系統樹図の出発点としてもご活用ください。
系統樹とは
系統樹（進化系統樹、系統発生図、または生命の樹の一部とも呼ばれます）は、種・遺伝子・系統が共通祖先を通じてどう関連しているかを示す分岐図です。末端の先端は比較される分類群を表し、内部ノードは共通祖先を示し、枝長は遺伝的分岐や進化時間を表すことができます。この系統樹メーカーは、記述された分類群と関係を、きれいでラベル付きの系統樹の図に描きます。生の配列データから系統を推定するのではなく、図を配置して注釈を付けるものなので、公表された樹形図を描き直したり、進化的関係を分かりやすく示したりするのに最適です。
系統樹メーカーを使う理由
- 系統樹は進化生物学・ゲノミクス・疫学・比較解剖学の基礎であり、学生も研究者も絶えず構築しています。
- MEGA・IQ-TREE・FigTreeなどの専門ソフトは習得が難しく、図を描くだけのために生の配列データを要求します。
- テキストの記述から進化系統樹を描く方が、バイオインフォマティクスのパイプラインからのSVG書き出しと格闘するよりはるかに速いです。
- 枝長によって、系統樹は分岐時間や遺伝的変化を示せます。これは単純な分岐図では伝えられない定量的な意味です。
- きれいでラベル付きの系統発生図は、論文・スライド・ポスター・生物学の授業で進化的関係を読み取りやすくします。
系統樹の作り方
分類群（種・遺伝子・系統）を挙げ、示したい関係を記述します。分岐の順序、どの分類群が外群か、枝長の情報（分岐時間や遺伝的距離）、共通祖先名やブートストラップ支持度などのノードラベルです。分子系統樹の場合は使用したマーカー（16S rRNA、シトクロムb、ITSなど）に言及し、時間較正された樹形樹の場合はおおよその分岐年代を加えます。樹形樹を生成したら、姉妹群が意図した進化的関係と一致するか確認します。系統樹の図が思いどおりに読めるようになるまで、記述を調整して系統樹形・枝長・ラベルを変更してください。
系統樹の構成要素
- 分類群（葉の先端）— 比較される種・遺伝子・系統で、枝の末端に配置されます。
- 枝 — 祖先からその子孫への系統をたどる接続線。
- 内部ノード — そこから派生する群が共有する仮想的な共通祖先を表す分岐点。
- 根 — 樹形樹内のすべての分類群の最も古い共通祖先で、通常は図全体の向きを定める外群によって設定されます。
- 枝長 — 真の系統樹（分岐図とは異なり）では、遺伝的変化や進化時間にスケールできます。
- クレードとラベル — 命名された群・外群マーカー・支持値（ブートストラップや事後確率）が樹形樹に注釈を付けます。
系統樹メーカー よくある質問
系統樹とは何ですか?
系統樹（進化系統樹、系統発生とも呼ばれます）は、種・遺伝子・系統の間の推定された進化的関係を、共通祖先を通じて示す分岐図です。先端は分類群、内部ノードは共通祖先で、枝長はしばしば遺伝的分岐や時間を表します。これは枝長に意味のない分岐図とは異なります。
オンラインで系統樹を作るには?
分類群とその関係（分岐の順序・外群・任意の枝長や分岐時間・各種のノードラベル）を記述すると、このオンライン系統樹メーカーがきれいでラベル付きの進化系統樹を描きます。ソフトウェアのインストールは不要で、テキストから系統樹を構築し、記述を調整して系統樹形・枝長・注釈を変更できます。
系統樹と分岐図の違いは何ですか?
分岐図は分岐の順序、すなわちどれがどれにより近縁かのみを示し、スケールがないため枝長は任意です。系統樹はその系統樹形を保ちつつ、枝長を遺伝的変化（サイトあたりの置換）や、時間較正された樹形樹では時間にスケールできます。枝長に意味を持たせたい場合は系統樹を使い、相対的な近縁性だけが必要なら別の分岐図メーカーをご覧ください。
系統樹はどう読めばよいですか?
系統樹は先端から根に向かって読みます。先端は比較される分類群です。2つの先端をその枝が合流するまでたどると、そのノードが両者の最も近い共通祖先です。より新しいノードを共有する分類群ほど近縁です。枝長がスケールされている場合、長い枝はより多くの遺伝的変化や経過時間を意味し、クレードは1つの祖先とそのすべての子孫からなる群です。
無料ですか?
1回の生成で少量のクレジットを使用し、新規アカウントには無料クレジットが付与されるため、サブスクリプションなしで系統樹を作成できます。多くの図を描く必要がある場合は追加クレジットを利用できます。
生物学の授業や研究論文の図に使えますか?
はい。樹形樹はきれいで出版品質なので、生物学の課題・講義スライド・ポスター、公表された系統をまとめる総説や教科書の図に適しています。一次研究の場合、このツールは配列アラインメントから計算するのではなく樹形樹を描いてラベルを付けるものなので、描かれた系統樹形が推定した系統と一致することを確認し、データの出典を引用してください。
