無料のデンドログラム メーカー

デンドログラムとは何ですか？

デンドログラムは、階層的クラスタリングによって生成されるツリー図で、個々の項目が次々とクラスタへ統合される様子を示します。2つの枝が結合する高さは、それらのクラスタ間の連結距離なので、低い位置で出会う枝はより似た項目を、高い位置で出会う枝はより離れたものを表します。このデンドログラム メーカーは、プレーンテキストの説明を、きれいでラベル付きの階層的クラスタリングツリーに変換します。項目・距離やクラスタ・カット線を説明すると、AIが、連結距離軸・ラベル付きのリーフ・任意の色分けクラスタを備えた、適切な比率の図を、表計算やコーディングなしで生成します。

デンドログラム メーカーを使う理由

• デンドログラムは、階層的クラスタリング構造と、項目が異なる類似度でどう群がるかを示す標準的な方法です。
• R・scipy・seabornで論文品質のクラスタツリーを作るには、分析から気をそらす連結コードと整形が必要です。
• 階層的クラスタリングと連結を学ぶ学生は、明確にラベル付けされたデンドログラムから、統合と距離をはるかによく理解できます。
• 研究者は、ゲノミクス・生態学・分類学のスライド・実験レポート・論文用に、すばやく見せられるクラスタデンドログラムを必要とします。
• 項目・クラスタ数・ツリーを切る位置を変えて再生成する方が、クラスタリングのコードを手で編集するよりずっと速いです。

デンドログラムの作り方

クラスタリングする項目に名前を付け、それらがどう群がるか — どれが最も似ていて最初に結合するか、どれが別々のクラスタを形成するか — を説明します。次に、必要な視覚的特徴を加えます。連結距離または高さ軸、クラスタで色分けされた枝、クラスタ数を定義する破線の水平カット線、水平方向の向き、付属のヒートマップなどです。デンドログラムを生成し、リーフのラベル・統合の高さ・クラスタの色を確認して、不明な点があれば説明を調整してください。

デンドログラムの構成要素

• リーフ — ツリーの先端。クラスタリングされた項目ごとに1つで、サンプル名や種名などのラベルを持つ。
• 枝とノード — ツリーを上に進むにつれて2つのクラスタが1つに結合する線と統合点。
• 距離 / 高さ軸 — 各結合が配置される連結距離スケール。結合が低いほど項目が似ている。
• リーフ順 — 枝が交差しないように選ばれた、リーフの左右（または上下）の並び順。
• 色分けクラスタ — 選んだ高さでツリーを切った後、枝をグループに色分けする任意の彩色。
• カット線 — ツリーを横切る水平線で、選んだ数のクラスタに切り分ける。