Outil de création d'arbre phylogénétique gratuit
Générez un arbre évolutif étiqueté à partir d'un texte simple
Décrivez vos espèces, gènes ou séquences et leurs relations, et l'IA dessine un arbre phylogénétique propre et étiqueté montrant l'histoire évolutive — prêt pour les articles de recherche, les présentations et les cours de biologie.
Exemples d'arbres phylogénétiques
Cliquez sur un exemple pour charger son invite, ou utilisez-le comme point de départ pour votre propre diagramme d'arbre évolutif.
Que fait cet outil de création d'arbre phylogénétique ?
Il convertit une description d'organismes, de gènes ou de séquences et de leurs relations évolutives en un arbre phylogénétique propre et étiqueté — le diagramme standard que les biologistes utilisent pour représenter l'histoire évolutive et la parenté. Contrairement à un cladogramme (qui montre uniquement l'ordre de ramification sans échelle), un arbre phylogénétique peut aussi encoder des longueurs de branches représentant la divergence génétique ou le temps. Vous décrivez vos taxons et les preuves (moléculaires, morphologiques ou temporelles), et l'IA génère un arbre annoté et soigné prêt à utiliser dans des rapports, des publications ou des cours — sans logiciel spécialisé comme MEGA, RAxML ou FigTree.
Pourquoi utiliser un outil de création d'arbre phylogénétique
- Les arbres phylogénétiques sont fondamentaux en biologie évolutive, génomique, épidémiologie et anatomie comparée — les chercheurs et les étudiants en construisent régulièrement.
- Les logiciels bioinformatiques spécialisés (MEGA, IQ-TREE, FigTree) ont une courbe d'apprentissage élevée et nécessitent des données de séquences brutes pour générer des figures.
- La mise à l'échelle des longueurs de branches selon les temps de divergence ou les taux de substitution ajoute une signification quantitative que les cladogrammes ne peuvent pas transmettre.
- Les épidémiologistes et les virologues ont besoin de phylogénies claires et rapides pour suivre la propagation des pathogènes et les passages zoonotiques.
- Générer un arbre de qualité présentation à partir d'une description textuelle est bien plus rapide que d'éditer les exports SVG des pipelines bioinformatiques.
Comment créer un arbre phylogénétique
Listez vos taxons (espèces, gènes ou souches) et décrivez les relations à montrer — ordre de ramification, désignation du groupe externe, informations sur les longueurs de branches (temps de divergence ou distances génétiques), et étiquettes de nœuds telles que les noms d'ancêtres communs ou les valeurs de support bootstrap. Pour un arbre moléculaire, mentionnez le gène ou le marqueur utilisé (ex. ARNr 16S, cytochrome b, ITS). Pour un arbre daté, incluez des dates de divergence approximatives. Générez l'arbre, vérifiez que les groupes frères reflètent les relations évolutives connues, et affinez votre description pour ajuster la topologie ou les annotations selon les besoins.
Parties d'un arbre phylogénétique
- Taxons (feuilles/extrémités) — les organismes, gènes ou séquences comparés, positionnés aux extrémités des branches.
- Nœuds internes — points de divergence représentant des ancêtres communs hypothétiques des groupes qui en descendent.
- Longueurs de branches — dans un arbre phylogénétique (contrairement à un cladogramme), les longueurs peuvent représenter le changement génétique ou le temps évolutif écoulé.
- Racine — l'ancêtre commun le plus ancien de tous les taxons de l'arbre, généralement établi à l'aide d'un groupe externe.
- Groupe externe — un taxon connu pour être plus éloigné que tous les autres, utilisé pour enraciner et orienter l'arbre.
- Valeurs de support des nœuds — pourcentages de bootstrap ou probabilités a posteriori bayésiennes indiquant la confiance dans chaque point de ramification.
FAQ sur l'outil de création d'arbre phylogénétique
Qu'est-ce qu'un arbre phylogénétique ?
Un arbre phylogénétique (également appelé arbre évolutif ou phylogénie) est un diagramme ramifié qui représente les relations évolutives inférées entre des espèces, des gènes ou d'autres entités biologiques, généralement dérivées de données moléculaires ou morphologiques. Les longueurs de branches représentent souvent la divergence génétique ou le temps, contrairement à un cladogramme où elles n'ont pas de signification.
Quelle est la différence entre un arbre phylogénétique et un cladogramme ?
Un cladogramme montre uniquement l'ordre de ramification — qui est plus proche de qui — sans aucune échelle. Un arbre phylogénétique préserve cette topologie mais met en outre les longueurs de branches à l'échelle du changement génétique (substitutions par site) ou du temps géologique dans un arbre daté. Si vous avez besoin d'informations quantitatives sur les longueurs de branches, utilisez un arbre phylogénétique ; si vous devez seulement montrer la parenté relative, un cladogramme suffit.
Puis-je inclure des longueurs de branches ou des temps de divergence ?
Oui. Dans votre description, précisez les temps de divergence approximatifs (ex. « humains et chimpanzés ont divergé il y a environ 6 millions d'années ») ou les distances génétiques relatives, et l'IA affichera des longueurs de branches à l'échelle. Vous pouvez aussi demander un style dendrogramme où toutes les extrémités sont alignées et seules les proportions des branches internes varient.
Puis-je créer un arbre phylogénétique moléculaire sans données de séquences brutes ?
Oui — cet outil génère des arbres phylogénétiques illustratifs à partir de votre description textuelle des relations, de la topologie et des preuves. Il est idéal pour créer des figures pédagogiques, des diagrammes conceptuels ou des graphiques de présentation basés sur des phylogénies publiées. Pour une recherche primaire nécessitant l'inférence d'arbres directement à partir d'un alignement de séquences, vous devrez toujours utiliser un logiciel dédié comme IQ-TREE ou MrBayes.
Est-il adapté aux articles de recherche et aux figures de demandes de subvention ?
Oui. Les figures sont propres et de qualité publication. Pour la recherche primaire, vérifiez que la topologie représentée correspond à votre phylogénie inférée et citez votre source de données. Pour les revues, manuels et présentations résumant des phylogénies publiées, l'arbre généré est prêt à l'emploi.
Est-il gratuit ?
Chaque génération utilise un petit nombre de crédits. Les nouveaux comptes reçoivent des crédits gratuits, ce qui vous permet de créer un arbre phylogénétique sans abonnement. Des crédits supplémentaires sont disponibles si vous devez générer de nombreuses figures.
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