Outil de création d'arbre phylogénétique gratuit
Générez un arbre évolutif étiqueté à partir d'un texte simple
Décrivez vos espèces, gènes ou séquences et leurs relations, et l'IA dessine un arbre phylogénétique propre et étiqueté montrant l'histoire évolutive — prêt pour les articles de recherche, les présentations et les cours de biologie.
Exemples d'arbres phylogénétiques
Cliquez sur un exemple pour charger son invite, ou utilisez-le comme point de départ pour votre propre diagramme d'arbre évolutif.
Qu'est-ce qu'un arbre phylogénétique ?
Un arbre phylogénétique (aussi appelé arbre évolutif, diagramme de phylogénie ou élément de l'arbre de la vie) est un diagramme arborescent qui montre comment des espèces, des gènes ou des souches sont apparentés par des ancêtres communs partagés. Les extrémités représentent les taxons comparés, les nœuds internes marquent les ancêtres communs, et les longueurs de branches peuvent coder la divergence génétique ou le temps évolutif. Ce créateur d'arbres phylogénétiques reprend les taxons et les relations que vous décrivez et dessine pour vous un diagramme phylogénétique net et annoté. Il met en page et annote la figure plutôt que d'inférer la phylogénie à partir de données de séquences brutes : il est donc idéal pour redessiner des arbres publiés ou illustrer clairement des relations évolutives.
Pourquoi utiliser un créateur d'arbres phylogénétiques
- Les arbres phylogénétiques sont fondamentaux en biologie évolutive, en génomique, en épidémiologie et en anatomie comparée : étudiants et chercheurs en construisent sans cesse.
- Les logiciels spécialisés comme MEGA, IQ-TREE ou FigTree ont une courbe d'apprentissage abrupte et exigent des données de séquences brutes rien que pour dessiner une figure.
- Dessiner un arbre évolutif à partir d'une description en texte clair est bien plus rapide que de se débattre avec les exports SVG de pipelines bio-informatiques.
- Les longueurs de branches permettent à un arbre phylogénétique d'indiquer des temps de divergence ou un changement génétique — un sens quantitatif qu'un simple cladogramme ne peut transmettre.
- Un diagramme de phylogénie net et annoté rend les relations évolutives faciles à lire dans les articles, les diapositives, les posters et les cours de biologie.
Comment créer un arbre phylogénétique
Listez vos taxons — espèces, gènes ou souches — et décrivez les relations à montrer : ordre de branchement, quel taxon constitue le groupe externe, toute information sur les longueurs de branches (temps de divergence ou distances génétiques), et les libellés de nœuds tels que les noms d'ancêtres communs ou les valeurs de soutien (bootstrap). Pour un arbre moléculaire, mentionnez le marqueur utilisé (par ex. ARNr 16S, cytochrome b, ITS) ; pour un arbre calibré dans le temps, ajoutez des dates de divergence approximatives. Générez l'arbre, puis vérifiez que les groupes frères correspondent aux relations évolutives que vous visez. Affinez votre description pour ajuster la topologie, les longueurs de branches ou les libellés jusqu'à ce que le diagramme phylogénétique se lise comme vous le souhaitez.
Éléments d'un arbre phylogénétique
- Taxons (extrémités des feuilles) — les espèces, gènes ou souches comparés, placés à l'extrémité des branches.
- Branches — les lignes de connexion qui retracent les lignées, des ancêtres à leurs descendants.
- Nœuds internes — points de branchement qui représentent les ancêtres communs hypothétiques partagés par les groupes qui en descendent.
- Racine — l'ancêtre commun le plus ancien de tous les taxons de l'arbre, généralement définie par un groupe externe qui oriente l'ensemble de la figure.
- Longueurs de branches — dans un véritable arbre phylogénétique (contrairement à un cladogramme), elles peuvent être proportionnelles au changement génétique ou au temps évolutif.
- Clades et libellés — groupes nommés, marqueurs de groupe externe et valeurs de soutien (bootstrap ou probabilités a posteriori) qui annotent l'arbre.
FAQ du créateur d'arbres phylogénétiques
Qu'est-ce qu'un arbre phylogénétique ?
Un arbre phylogénétique, aussi appelé arbre évolutif ou phylogénie, est un diagramme arborescent qui montre les relations évolutives inférées entre des espèces, des gènes ou des souches à travers des ancêtres communs partagés. Les extrémités sont les taxons, les nœuds internes sont les ancêtres communs, et les longueurs de branches représentent souvent la divergence génétique ou le temps — contrairement à un cladogramme, où les longueurs de branches n'ont aucune signification.
Comment créer un arbre phylogénétique en ligne ?
Décrivez vos taxons et la façon dont ils sont apparentés — ordre de branchement, groupe externe, longueurs de branches ou temps de divergence optionnels, et libellés de nœuds — et ce créateur d'arbres phylogénétiques en ligne dessine pour vous un arbre évolutif net et annoté. Aucun logiciel à installer : vous construisez un arbre phylogénétique à partir d'un texte clair, puis vous affinez la description pour ajuster la topologie, les longueurs de branches ou les annotations.
Quelle est la différence entre un arbre phylogénétique et un cladogramme ?
Un cladogramme ne montre que l'ordre de branchement — qui est le plus étroitement apparenté à qui — sans échelle, de sorte que ses longueurs de branches sont arbitraires. Un arbre phylogénétique conserve cette topologie mais peut rendre les longueurs de branches proportionnelles au changement génétique (substitutions par site) ou au temps dans un arbre calibré dans le temps. Utilisez un arbre phylogénétique lorsque les longueurs de branches doivent avoir un sens ; si vous n'avez besoin que de la parenté relative, voyez notre créateur de cladogrammes distinct.
Comment lire un arbre phylogénétique ?
Lisez un arbre phylogénétique des extrémités vers la racine. Les extrémités sont les taxons comparés ; remontez deux extrémités jusqu'à ce que leurs branches se rejoignent, et ce nœud est leur ancêtre commun le plus récent. Les taxons qui partagent un nœud plus récent sont plus étroitement apparentés. Lorsque les longueurs de branches sont à l'échelle, des branches plus longues signifient un changement génétique plus important ou un temps écoulé plus long, et un clade est tout ancêtre accompagné de l'ensemble de ses descendants.
Est-ce gratuit ?
Chaque génération consomme un petit nombre de crédits, et les nouveaux comptes reçoivent des crédits gratuits : vous pouvez donc créer un arbre phylogénétique sans aucun abonnement. Des crédits supplémentaires sont disponibles si vous avez besoin de dessiner de nombreuses figures.
Puis-je l'utiliser pour un cours de biologie et des figures d'articles de recherche ?
Oui. Les arbres sont nets et de qualité publication : ils conviennent donc aux devoirs de biologie, aux diapositives de cours, aux posters et aux figures d'articles de synthèse ou de manuels qui résument des phylogénies publiées. Pour la recherche primaire, vérifiez que la topologie dessinée correspond à votre phylogénie inférée et citez votre source de données, puisque cet outil dessine et annote l'arbre plutôt que de le calculer à partir d'alignements de séquences.
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