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科学图示符号参考

画通路图或机制图时,你选的箭头本身就带含义:尖头代表激活,T 形横杠代表抑制,空心圆代表催化。这页给出每种关系对应的正确符号,并告诉你哪些符号有可引用的正式标准、哪些只是被广泛使用的惯例。

SBGN 过程描述(Process Description)弧线(正式标准)

系统生物学图形符号(SBGN)的过程描述语言为“某实体如何作用于某过程”定义了精确的线端形状。以下是规范形状,符号按官方 SBGN PD Level 1 用户手册绘制。

符号弧线含义线端(据 SBGN PD 手册)
消耗反应物被某一过程消耗末端无符号的简单线条
生成过程产生某一产物实心(填充)箭头
刺激 / 激活对过程的通量产生正向影响空心(未填充)箭头
催化刺激的一种特殊情形(酶催化某一过程)空心圆
抑制对过程的通量产生负向影响与弧线垂直的横杠(T 形横杠)
调节影响通量,但不指明正向或负向空心菱形
必需刺激过程发生所必需的刺激一条横杠后接空心箭头
重要:只有当图明确声明采用 SBGN(或类似规范)时,“尖头箭头=激活 / T 形横杠=抑制”才是正式标准。在普通分子生物学图里,它是被广泛共享的惯例,而非标准——这正是 SBGN 被创建的原因:让符号无需长图注也能明确解读。

符号标准与惯例

哪些是正式的、带版本的标准,哪些是惯例。正式标准有可引用的官方规范;惯例被广泛使用但未标准化。

SBGN — Process Description (PD)正式标准

机制性、具有时序的生化过程 —— 最接近教科书中的代谢通路和调控通路。定义了过程节点和九种弧线。

维护方: SBGN 社区(隶属 COMBINE) · Level 1 (current PD version, successor to V2.0 2019 / V1.3 2015)

SBGN — Entity Relationship (ER)正式标准

某一实体参与的所有关系,不考虑时序因素。(此处未复现单个 ER 图元形状 —— 参见官方规范。)

维护方: SBGN 社区(隶属 COMBINE) · Level 1 Version 2.0 (2015)

SBGN — Activity Flow (AF)正式标准

生化实体之间信息/影响的流动 —— 适用于表示扰动效应。(此处未复现单个 AF 图元形状 —— 参见官方规范。)

维护方: SBGN 社区(隶属 COMBINE) · Level 1 Version 1.2 (2015)

Activation-arrow vs inhibition-bar semantics惯例

尖头箭头 = 激活,平头横杠/T 形横杠 = 抑制。只有当图件声明采用 SBGN 时才是形式化规定;在普通分子生物学图件中,它只是通行惯例,而非标准。

维护方: 社区惯例(仅在 SBGN 内部形式化) · N/A

CONSORT flow diagram正式标准

受试者在随机对照试验中的流转,分为四个阶段:入组 → 分配 → 随访 → 分析,并记录每个环节的人数和排除情况。

维护方: CONSORT Group · CONSORT 2025 (updates 2001, 2010)

IEC 60617 — Graphical Symbols for Diagrams正式标准

电工/电子图形符号的国际标准。在欧洲、中国、澳大利亚及亚洲大部分地区使用。

维护方: 国际电工委员会(IEC) · Maintained symbol database (~1,900 symbols)

IEEE/ANSI 315 — Graphic Symbols for Electrical and Electronics Diagrams正式标准

北美的电路图符号和参考代号字母。与 IEC 大体保持兼容,但部分器件形状有所不同。

维护方: IEEE · IEEE 315 (Inactive-Reserved since 7 Nov 2019)

常见问题

激活和抑制应该怎么画?

在 SBGN 中,刺激/激活以空心(未填充)箭头结尾,抑制以垂直于线的横杠(T 形横杠)结尾。在 SBGN 之外,这套配对是常见惯例而非强制标准,但遵循它能让图无需图注也易读。

画通路图必须用 SBGN 吗?

不必——SBGN 是可选的。它是一套你可以采用的正式标准,让通路图或机制图明确无歧义,含三种语言(过程描述、实体关系、活动流)。很多已发表的图使用类 SBGN 惯例,但并未正式遵循规范。

电路图或试验流程图有什么标准?

电路符号由 IEC 60617(国际)和 IEEE/ANSI 315(北美,现为 inactive-reserved)标准化。随机对照试验的受试者流程遵循 CONSORT 流程图——一套正式的报告标准,含四个阶段:入组、分配、随访、分析。

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