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Referência de Notação de Diagramas Científicos

Quando você desenha um diagrama de via ou de mecanismo, a seta escolhida carrega significado: uma ponta pontiaguda é lida como ativação; uma barra em T, como inibição; um círculo vazado, como catálise. Esta página mostra o glifo correto para cada relação e indica quais símbolos têm respaldo de um padrão formal que você pode citar e quais são apenas uma convenção amplamente usada.

Arcos de Descrição de Processo da SBGN (padrão formal)

A linguagem de Descrição de Processo da Systems Biology Graphical Notation (SBGN) define formas precisas de terminação de linha para como uma entidade age sobre um processo. Estas são as formas canônicas; os glifos abaixo foram desenhados para corresponder ao Manual do Usuário oficial da SBGN PD Nível 1.

GlifoArcoSignificadoTerminação de linha (conforme manual SBGN PD)
ConsumoUm reagente é consumido por um processoUma linha simples, sem símbolo na extremidade
ProduçãoUm processo gera um produtoUma ponta de seta preenchida (sólida)
Estimulação / ativaçãoAfeta positivamente o fluxo de um processoUma ponta de seta vazia (não preenchida)
CatáliseUm caso especial de estimulação (uma enzima catalisa um processo)Um círculo vazio
InibiçãoAfeta negativamente o fluxo de um processoUma barra perpendicular ao arco (barra em T)
ModulaçãoAfeta o fluxo sem especificar sinal positivo ou negativoUm losango vazio
Estimulação necessáriaEstimulação que é indispensável para que o processo ocorraUma barra seguida de uma ponta de seta aberta
Importante: o par seta-pontiaguda-para-ativação / barra-em-T-para-inibição é um PADRÃO FORMAL apenas quando uma figura declara SBGN (ou uma especificação semelhante). Em uma figura comum de biologia molecular, é uma CONVENÇÃO amplamente compartilhada, e não um padrão — o que é exatamente o motivo pelo qual a SBGN foi criada: tornar a notação inequívoca sem uma longa legenda.

Padrões e convenções de notação

Quais sistemas são padrões formais e versionados e quais são convenções. Os padrões formais têm uma especificação oficial que você pode citar; as convenções são amplamente usadas, mas não padronizadas.

SBGN — Process Description (PD)Padrão formal

Processos bioquímicos mecanísticos e temporais — o mais próximo das vias metabólicas e regulatórias dos livros-texto. Define nós de processo e nove arcos.

Mantido por: Comunidade SBGN (sob a COMBINE) · Level 1 (current PD version, successor to V2.0 2019 / V1.3 2015)

SBGN — Entity Relationship (ER)Padrão formal

Todas as relações das quais uma entidade participa, independentemente de aspectos temporais. (As formas individuais dos glifos ER não são reproduzidas aqui — consulte a especificação oficial.)

Mantido por: Comunidade SBGN (sob a COMBINE) · Level 1 Version 2.0 (2015)

SBGN — Activity Flow (AF)Padrão formal

Fluxo de informação/influência entre entidades bioquímicas — útil para efeitos de perturbação. (As formas individuais dos glifos AF não são reproduzidas aqui — consulte a especificação oficial.)

Mantido por: Comunidade SBGN (sob a COMBINE) · Level 1 Version 1.2 (2015)

Activation-arrow vs inhibition-bar semanticsConvenção

Ponta de seta pontiaguda = ativação, barra reta/barra em T = inibição. Formalizado quando uma figura declara SBGN; em uma figura de biologia molecular sem essa declaração, trata-se de uma convenção compartilhada, não de um padrão.

Mantido por: Prática da comunidade (formalizada apenas dentro do SBGN) · N/A

CONSORT flow diagramPadrão formal

Fluxo de participantes ao longo de um ensaio clínico randomizado em quatro etapas: Inclusão → Alocação → Seguimento → Análise, registrando contagens e exclusões em cada transição.

Mantido por: Grupo CONSORT · CONSORT 2025 (updates 2001, 2010)

IEC 60617 — Graphical Symbols for DiagramsPadrão formal

Norma internacional para símbolos de diagramas eletrotécnicos/eletrônicos. Usada na Europa, na China, na Austrália e em grande parte da Ásia.

Mantido por: Comissão Eletrotécnica Internacional (IEC) · Maintained symbol database (~1,900 symbols)

IEEE/ANSI 315 — Graphic Symbols for Electrical and Electronics DiagramsPadrão formal

Símbolos esquemáticos norte-americanos e letras de designação de referência. Mantido amplamente compatível com a IEC, embora algumas formas de dispositivos difiram.

Mantido por: IEEE · IEEE 315 (Inactive-Reserved since 7 Nov 2019)

Perguntas frequentes

Como a ativação e a inibição devem ser desenhadas?

Na SBGN, a estimulação/ativação termina em uma ponta de seta vazia (não preenchida) e a inibição termina em uma barra perpendicular à linha (uma barra em T). Fora da SBGN, esse mesmo par é uma convenção comum em vez de um padrão obrigatório, mas segui-lo mantém sua figura legível sem uma legenda.

A SBGN é obrigatória para figuras de vias?

Não — a SBGN é opcional. É um padrão formal que você pode adotar para tornar uma figura de via ou mecanismo inequívoca, com três linguagens (Descrição de Processo, Relação de Entidades e Fluxo de Atividade). Muitas figuras publicadas usam convenções semelhantes à SBGN sem seguir formalmente a especificação.

Qual padrão rege diagramas de circuito ou de fluxo de ensaios?

Os símbolos de circuito são padronizados pela IEC 60617 (internacional) e pela IEEE/ANSI 315 (América do Norte, agora inativa-reservada). O fluxo de participantes de ensaios randomizados segue o diagrama de fluxo CONSORT — um padrão formal de relato com quatro etapas: Inclusão, Alocação, Acompanhamento e Análise.

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