Генератор тепловых карт

Преобразуйте CSV-данные в научную тепловую карту для публикации

Генератор тепловых карт преобразует структурированные научные данные в статистическое представление, для которого предназначен этот тип графика. Он подходит для «Тепловая карта экспрессии генов», «Скрининговый планшет жизнеспособности клеток» и близких задач; Python создаёт воспроизводимую первую версию, а SciVis помогает оформить результат.

Данные CSV и ExcelНаучные цветовые шкалыЭкспорт для публикацийРедактирование в SciVis

ИИ-генератор тепловых карт

Ввод данных

Перетащите файл данных сюда или нажмите, чтобы загрузить

CSV, TSV, TXT, Excel · Макс. 5MB

Стоит 10 кредитовCSV, TSV, TXT или Excel

Предпросмотр

Пример

Предпросмотр использует выбранный набор примеров. Постройте его с помощью Python или загрузите собственные данные.

Примеры Генератор тепловых карт с данными для скачивания

Откройте пример, чтобы изучить график, скачать CSV или загрузить те же данные в генератор выше.

Что делает этот генератор тепловых карт?

Зачем исследователям тепловые карты

Сравнивать множество измерений между образцами или условиями на одной компактной фигуре.
Быстро находить области высоких и низких значений, блоки, градиенты и выбросы.
Использовать расходящуюся шкалу для значений вокруг осмысленной середины, например нуля.
Преобразовывать исходную матрицу в подписанную фигуру для статьи, постера или доклада.
Переносить результат в SciVis для настройки аннотаций, цветов, компоновки и экспорта.

Как построить тепловую карту по CSV

Подготовьте tidy-данные: один столбец для горизонтальной категории, один для вертикальной и одно числовое значение для цвета. Загрузите файл или пример, проверьте предварительный вид и создайте первую тепловую карту. Скачайте результат сразу или выберите редактирование в SciVis.

Что должно быть на научной тепловой карте

Понятно названные переменные строк и столбцов.
Последовательная или расходящаяся шкала, соответствующая типу данных.
Легенда с единицами, типом оценки или диапазоном корреляции.
Читаемые подписи категорий без лишнего декора.
Осмысленная середина для fold change, z-оценок или корреляций.
Достаточное разрешение и форматы экспорта для журнала или слайдов.

Частые вопросы о генераторе тепловых карт

Какой формат данных использовать для тепловой карты?

Лучше всего подходят tidy-данные: столбец категории X, столбец категории Y и числовой столбец цвета. Поддерживаются CSV, TSV, TXT, XLSX и XLS.

Можно ли создать тепловую карту экспрессии генов?

Да. Разместите гены по строкам, образцы по столбцам, а экспрессию, fold change или z-оценку используйте для цвета. Готовый пример CSV уже включён.

Генератор тепловых карт или Генератор корреляционной матрицы?

Обычная тепловая карта показывает измерения: экспрессию генов, результаты скрининга или матрицу признаков. Матрица корреляций нужна, когда каждая ячейка — коэффициент для пары переменных.

Можно ли редактировать карту после создания?

Да. Страница создаёт первый график. Нажмите «Редактировать в SciVis», чтобы изменить цвета, подписи, компоновку, аннотации и другие детали.

Какие форматы экспорта доступны?

Предварительный результат можно скачать в PNG. В SciVis также доступны ориентированные на публикацию PDF, TIFF и EPS, если они поддерживаются результатом.

Примеры действительно построены по скачиваемым данным?

Да. Каждый пример отрисован из соответствующего CSV, поэтому вы можете воспроизвести ту же структуру, а затем подставить собственные измерения.