Научная визуализация с ИИ: графики из CSV и Excel

Научная визуализация должна начинаться с проверяемых данных и заканчиваться рисунком, где можно проверить значения, визуальные кодировки и подписи. SciDraw создает черновик на странице инструмента, а редактирование продолжается в SciVis.

SciVis →

Поддерживаемые форматы

Поддерживаются CSV, TSV, TXT, XLSX и XLS. За один раз загружается один файл; для Excel импортируется первый лист. JSON и несколько файлов одновременно не поддерживаются. Группы, ряды и неопределенности обычно помещаются в одну длинную таблицу.

Рабочий процесс SciVis

1. Выбрать страницу графика под исследовательский вопрос.
2. Взять один из шести примеров или загрузить свой файл.
3. Проверить распознанные столбцы и создать первый рисунок.
4. Нажать «Продолжить редактирование в SciVis».
5. Перед экспортом проверить значения, статистику и правила журнала.

46 опубликованных инструментов

Опубликовано 46 инструментов для сравнений, распределений, временных рядов, регрессии, неопределенности, выживаемости, омиксных и потоковых данных. PCA и хороплетные карты остаются офлайн до полной проверки надежности. Список находится в каталоге инструментов.

Новые инструменты для исследовательских сценариев

Следующие 23 страниц содержат по шесть скачиваемых наборов для реальных задач и открывают результат в SciVis:

• Конструктор столбчатых диаграмм — Загрузите CSV, создайте сгруппированную, накопительную диаграмму или график с погрешностями и настройте подписи и стиль в SciVis.
• Конструктор линейных графиков — Загрузите CSV, постройте готовый к публикации линейный график и настройте ряды, подписи и цвета в SciVis.
• Генератор графиков с полосами погрешности — Загрузите CSV, отобразите стандартное отклонение, ошибку или доверительный интервал и продолжите редактирование в SciVis.
• Генератор графиков временных рядов — Загрузите временной ряд CSV, покажите тенденции и неопределённость и доработайте результат в SciVis.
• Генератор регрессионных графиков — Загрузите CSV, подберите регрессию и выведите статистики модели, затем продолжите редактирование в SciVis.
• Генератор кривых «доза–ответ» — Загрузите данные анализа CSV, подберите кривую IC50, EC50 или 4PL и доработайте рисунок в SciVis.
• Генератор кривых роста — Загрузите измерения роста CSV, сравните культуры или воздействия и продолжите редактирование в SciVis.
• Генератор стандартных кривых — Загрузите стандарты CSV, постройте кривую ELISA, qPCR или калибровки и настройте её в SciVis.
• Конструктор raincloud-графиков — Загрузите CSV, объедините распределение, блочную сводку и наблюдения и отредактируйте график в SciVis.
• Конструктор beeswarm-графиков — Загрузите наблюдения CSV, создайте beeswarm-график без наложения точек и настройте его в SciVis.
• Генератор ECDF-графиков — Загрузите наблюдения CSV, сравните эмпирические функции распределения и продолжите редактирование в SciVis.
• Генератор MA-графиков — Загрузите данные экспрессии CSV, сопоставьте логарифмические отношения с обилием и добавьте аннотации в SciVis.
• Генератор графиков обогащения — Загрузите результаты CSV, визуализируйте данные GO, KEGG или GSEA и доработайте рисунок в SciVis.
• Генератор графиков ферментативной кинетики — Загрузите данные анализа CSV, подберите модель ферментативной кинетики и отредактируйте кривые и аннотации в SciVis.
• Генератор календарных тепловых карт — Загрузите ежедневные измерения CSV, создайте календарную тепловую карту и настройте шкалу и подписи в SciVis.
• Генератор диаграмм с областями с накоплением — Стройте готовые для публикации диаграммы с областями с накоплением по CSV или Excel, показывая общий уровень и состав во времени, в том числе в масштабе 100%.

Как подготовить файл

• Одна наблюдаемая величина, проба или оценка на строку.
• Одна переменная на столбец и короткие уникальные имена.
• Числовые столбцы без единиц и декоративного текста.
• Группа, ряд, погрешность и подпись в отдельных столбцах.
• Единообразно обрабатывать пропуски и проверять единицы и коды.

Редактирование после создания

Страница инструмента отвечает за загрузку, примеры и первый черновик. Редактирование там не остается: в SciVis можно менять заголовок, оси, легенду, цвета, символы, аннотации, шкалы и компоновку.

Текущие ограничения и проверка

• Один файл за загрузку.
• Только первый лист Excel.
• JSON пока не поддерживается.
• Эффекты, интервалы, скорректированные p и модельные результаты должны поступать из корректного анализа.
• Требования журнала нужно проверить перед подачей.

Частые вопросы

• Достаточно одного файла? Обычно да; группы и ряды можно хранить в столбцах одной таблицы.
• Можно редактировать после создания? Да, результат открывается в SciVis и не остается на странице инструмента.
• У всех инструментов есть примеры? Да, для каждого из 46 опубликованных инструментов есть шесть CSV и обложки.

Начать работу

Выберите тип в каталоге инструментов или продолжите проект в SciVis. Сначала проверьте структуру на одном из примеров.