Генератор графиков обогащения

Что показывает Генератор графиков обогащения?

Генератор графиков обогащения преобразует структурированные научные данные в статистическое представление, для которого предназначен этот тип графика. Он подходит для «Обогащение биологических процессов GO», «Обогащение путей KEGG» и близких задач; Python создаёт воспроизводимую первую версию, а SciVis помогает оформить результат.

Требования к данным для Генератор графиков обогащения

• Пример полей: term, source, gene_ratio, gene_count, adjusted_p, neg_log10_adjusted_p.
• Одна строка должна соответствовать одному наблюдению, категории, моменту времени или корректной паре.
• Измерения хранятся как числа, а единицы указываются в названии столбца.
• Пустые ячейки считаются пропусками; итоговые строки и примечания перед загрузкой удаляются.

Научные примеры для Генератор графиков обогащения

• Обогащение биологических процессов GO
• Обогащение путей KEGG
• Накопленная оценка обогащения GSEA
• Обогащение онтологии заболеваний
• Обогащение маркеров типов клеток
• Обогащение мишеней факторов транскрипции

Зачем использовать Генератор графиков обогащения для научных данных?

• Сначала проверьте сопоставление полей на встроенном примере «Обогащение биологических процессов GO».
• Перенесите визуальную структуру примера «Обогащение путей KEGG» на сопоставимый набор данных.
• Используйте отрисовку Python без самостоятельного написания и отладки кода.
• Сохраните рассчитанные значения и доработайте подписи, цвета и экспорт в SciVis.

Как пользоваться Генератор графиков обогащения

Выберите пример или загрузите один файл CSV, TSV, TXT, XLSX либо XLS. Проверьте распознанные столбцы, создайте график и отредактируйте его в SciVis. Для Excel используется первый лист.

Что должно быть в понятном Генератор графиков обогащения

• Оси, группы или узлы последовательно сопоставлены с полями term, source, gene_ratio, gene_count, adjusted_p, neg_log10_adjusted_p.
• Заголовок называет результат или сравнение, которое показывает Генератор графиков обогащения.
• Подписи, единицы, легенды и необходимые опорные линии легко читаются.
• Сдержанная палитра и достаточное разрешение подходят для статей, постеров и слайдов.

Генератор графиков обогащения или Генератор пузырьковых диаграмм?

Выбирайте Генератор графиков обогащения, когда столбцы и исследовательский вопрос соответствуют его статистической структуре. Если главное — альтернативное сравнение, используйте Генератор пузырьковых диаграмм, чтобы не исказить данные визуальным кодированием.