ペアドットプロット作成ツール

ペアドットプロット（Paired Dot Plot）で可視化できること

ペアドットプロットは、同一の被験者、検体、測定部位、または実験ユニットから得られた反復測定データを線で結んで示す手法です。グループ平均の棒グラフでは隠れてしまう、個々のサンプルにおける変化の方向性（増加・減少）や変化の大きさをそのまま可視化します。

ペアドットプロット作成に必要なデータ要件

• 被験者ID、測定条件（前後など）、および数値の列を持つ「ロング型（1行1測定値）」、または被験者ごとに条件別の列を持つ「ワイド型」のデータを使用してください。
• 各ペアは、共通の被験者IDまたはサンプル識別子で正確に紐付けられている必要があります。
• ペアになっていない（対応のない）観測値を、誤って線で結ばないようにしてください。
• 複数のペア比較を同時に表示する場合は、グループ、時期、または治療条件の列を追加してください。

ペアドットプロットの学術・研究における活用例

• 血圧の介入前後ペアドット
• 臨床バイオマーカーの対応データ
• テスト前後得点の連結ドット
• ダンベル型の処置比較
• 対応のある遺伝子発現
• 測定装置の対応比較

ペアドットプロットを採用すべき理由

• 介入によって個々の被験者が同じ方向に変化したか、あるいは逆方向に変化したか（応答の不均一性）を明示できます。
• 個人内変動や、治療に対する多様な反応パターンを損なわずに提示できます。
• 統計検定を行う前に、欠損値やペアの不一致（対応漏れ）を視覚的に検出できます。
• 前後比較（Pre/Post）、左右比較、マッチドコントロール、または反復測定アッセイのデータを透明性高く提示できます。

ペアドットプロット作成ツール の使い方

例を選ぶか、CSV、TSV、TXT、XLSX、XLS のいずれか1ファイルをアップロードします。検出された列を確認して図を生成し、SciVis で編集します。Excel は先頭シートを使用します。

論文に耐えうるペアドットプロットの必須要素

• 各観測値を示す明確なプロット（点）と、有効なペアを結ぶ1本ずつの直線。
• 測定条件のラベルと正確な測定単位。
• プロットの数値としてではなく、ペアの紐付けのみに使用される一貫した被験者ID。
• 個々の軌跡（データポイント）を覆い隠さない範囲で追加された、平均値や中央値などの要約統計量。

ペアドットプロットと通常のドットプロットの使い分け

同一被験者に対する治療前後など、実験デザイン上データが「対応している（Paired）」場合はペアドットプロットを使用します。独立したグループ間の比較には、通常のドットプロットやビースウォーム（Beeswarm）プロットを使用してください。対応のないデータ同士を線で結ぶと、存在しない関係性を捏造することになります。