Generatore di grafici di arricchimento
Crea Generatore di grafici di arricchimento da dati sperimentali o di ricerca
Usa Generatore di grafici di arricchimento con dati CSV o Excel e rifinisci in SciVis il grafico generato da Python.
Crea un grafico scientifico
Trascina qui un file di dati o fai clic per caricarlo
CSV, TSV, TXT, Excel · Max 5MB
Anteprima
EsempioL’anteprima usa il set di dati selezionato. Rigenerala con Python o carica i tuoi dati per creare un nuovo grafico.
Esempi di Generatore di grafici di arricchimento con dati scaricabili
Apri un esempio per esaminare il grafico, scaricare il CSV o caricare gli stessi dati nel generatore qui sopra.
Che cosa mostra Generatore di grafici di arricchimento?
Generatore di grafici di arricchimento trasforma dati di ricerca strutturati nella relazione statistica propria di questo grafico. È adatto a Arricchimento GO dei processi biologici, Arricchimento dei pathway KEGG e analisi simili; Python crea una prima versione riproducibile e SciVis cura la finitura visiva.
Dati necessari per Generatore di grafici di arricchimento
- Campi rappresentativi: term, source, gene_ratio, gene_count, adjusted_p, neg_log10_adjusted_p.
- Ogni riga contiene un’osservazione, una categoria, un tempo o una coppia valida.
- Le misure devono essere numeriche e le unità vanno indicate nel nome della colonna.
- Le celle vuote sono considerate mancanti; rimuovi totali e note prima del caricamento.
Esempi di ricerca per Generatore di grafici di arricchimento
- Arricchimento GO dei processi biologici
- Arricchimento dei pathway KEGG
- Punteggio cumulativo di arricchimento GSEA
- Arricchimento dell’ontologia delle malattie
- Arricchimento dei marcatori di tipo cellulare
- Arricchimento dei bersagli dei fattori di trascrizione
Perché usare Generatore di grafici di arricchimento con dati di ricerca?
- Verifica prima l’associazione dei campi con l’esempio Arricchimento GO dei processi biologici incluso.
- Applica la struttura visiva di Arricchimento dei pathway KEGG a un set di dati confrontabile.
- Sfrutta il rendering Python senza scrivere o correggere personalmente il codice del grafico.
- Mantieni invariati i valori generati e rifinisci etichette, colori ed esportazione in SciVis.
Come usare Generatore di grafici di arricchimento
Scegli un esempio o carica un file CSV, TSV, TXT, XLSX o XLS. Controlla le colonne rilevate, genera il grafico e modificalo in SciVis. Per Excel viene importato il primo foglio.
Elementi di un Generatore di grafici di arricchimento leggibile
- Assi, gruppi o nodi sono associati in modo coerente da term, source, gene_ratio, gene_count, adjusted_p, neg_log10_adjusted_p.
- Il titolo specifica il risultato o il confronto mostrato da Generatore di grafici di arricchimento.
- Etichette, unità, legende e linee di riferimento necessarie restano leggibili.
- Colori sobri e una risoluzione adeguata funzionano per articoli, poster e diapositive.
Generatore di grafici di arricchimento o Creatore di grafici a bolle?
Scegli Generatore di grafici di arricchimento quando colonne e domanda seguono la sua struttura statistica. Se conta soprattutto il confronto alternativo, usa Creatore di grafici a bolle per evitare una codifica visiva fuorviante.
Domande frequenti su Generatore di grafici di arricchimento
Quali colonne servono per Generatore di grafici di arricchimento?
Il CSV incluso mostra la struttura consigliata. I campi rappresentativi sono term, source, gene_ratio, gene_count, adjusted_p, neg_log10_adjusted_p; vanno bene anche nomi equivalenti con lo stesso ruolo.
Quando usare Generatore di grafici di arricchimento invece di Creatore di grafici a bolle?
Usa Generatore di grafici di arricchimento per la relazione statistica che questo grafico è progettato a rappresentare. Scegli Creatore di grafici a bolle se il confronto alternativo risponde meglio alla domanda.
Posso modificare una figura dopo averla creata con Generatore di grafici di arricchimento?
Sì. Apri in SciVis la figura generata con Generatore di grafici di arricchimento per cambiare etichette, colori, annotazioni, impaginazione e altre impostazioni visive.
Posso usare le figure di Generatore di grafici di arricchimento in un articolo?
Sì. Generatore di grafici di arricchimento è pensato per figure scientifiche chiare e adatte alla pubblicazione. Prima dell’invio verifica sempre valori e norme della rivista.
Generatore di grafici di arricchimento consente l’esportazione ad alta risoluzione?
Sì. Dopo aver modificato una figura Generatore di grafici di arricchimento in SciVis puoi esportarla per articoli, poster, diapositive e relazioni.
Serve saper programmare per usare Generatore di grafici di arricchimento?
No. Il caricamento guidato di Generatore di grafici di arricchimento crea la prima versione e i controlli visivi di SciVis permettono di rifinirla.
Come usare Generatore di grafici di arricchimento con i dati della tua ricerca
Verifica la selezione del grafico, le colonne di dati richieste, l'interpretazione e i flussi di lavoro di visualizzazione scientifica prima di generare la figura finale per la pubblicazione.
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