
蘋果園土壤生物多樣性對於生產力至關重要,但通常僅針對有限數量的生物群體進行研究。我們利用環境DNA元條碼技術,針對義大利北部26個蘋果園的細菌、原生生物、真菌和無脊椎動物的土壤生物多樣性進行了研究,使用的標記基因包括16S和18S核醣體RNA、ITS和COI。於2023年夏季,我們評估了土壤上層20公分的化學和生物參數。我們採用了α和β多樣性分析、距離衰減關係、遷入率、群落組裝過程、空間和環境之間的方差分割,以及推定的細菌和真菌功能,以全面了解土壤群落的驅動因素。細菌和原生生物表現出比其他兩個群體更高的遷入率,支持了大小可塑性假說。所有群體普遍較低的遷入率與所有地點中出現的分類群數量較少有關。土壤群落主要由隨機過程組裝而成。

對受工業廢水污染的土壤樣本進行了宏基因組分析。提取了核酸,並使用凝膠電泳和 Qubit Nanodrop 評估了品質控制...