まず、DtpPの細胞外または膜表面ドメインが、ジペプチドおよびトリペプチド基質を特異的に認識する。次に、DtpPは基質と結合後、膜上のATP結合サブユニットと相互作用し、ATP結合を誘発する。第三に、ATP加水分解によってエネルギーが生成され、DtpPの膜貫通ドメインの構造変化を駆動し、基質が通過できるチャネルを形成する。第四に、基質は構造変化に伴い、細胞膜を通過して細胞内に入る。
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