
Abstract grafico di uno studio che mira a migliorare la diagnosi e la stratificazione del rischio nel cancro prostatico familiare attraverso l'integrazione di dati genomici, epigenomici e clinici. Abbiamo 2 individui affetti per ogni famiglia, mentre i campioni di controllo provengono da un database (il sangue viene estratto). Il sequenziamento dell'intero genoma viene eseguito utilizzando la tecnologia Oxford Nanopore: due livelli di informazione vengono ottenuti simultaneamente dalla stessa molecola di DNA: (1) variazione genetica (SNV, indel e varianti strutturali) e (2) metilazione del DNA (siti CpG e regioni regolatorie). Viene eseguita una caratterizzazione genomica ed epigenomica separata del cancro. Successivamente, viene eseguita l'integrazione multi-omica (mQTL): identificazione delle relazioni funzionali tra le varianti genetiche e le variazioni nella metilazione del DNA, nonché la loro associazione con le vie biologiche rilevanti del cancro prostatico. Infine, l'integrazione delle firme molecolari...
Un diagramma schematico che illustra l'impatto del lattato s...