Descrizione del prompt

Proposta di Design per Figura: Diagramma di Flusso Integrato Titolo della Figura: Strategia Computazionale e Sperimentale Integrata per l'Identificazione dei Regolatori Trascrizionali a Monte di Fgf4 Concetto di Design: Integra una "narrazione del processo da sinistra a destra" con una "presentazione dei risultati dall'alto verso il basso", fondendo strategia e risultati. Impiega colori professionali, alta densità di informazioni e una chiara guida visiva. Spiegazione Dettagliata e Punti di Miglioramento per Ogni Modulo: Lato Sinistro - Area del Diagramma di Flusso della Strategia Design: Utilizzare blocchi e frecce di colore in scala di grigi o a bassa saturazione per definire chiaramente i passaggi, riflettendo la metodologia. Aggiungere piccole icone (come una doppia elica di DNA o una lente d'ingrandimento) accanto ai passaggi "Predizione MEME" e "Comparazione TOMTOM" per migliorare il riconoscimento. Punti Chiave: Indicare i parametri chiave, come l'intervallo di sequenza, la soglia del valore E di MEME e il nome del database utilizzato. Centro - Area di Visualizzazione dei Risultati In Alto (Visualizzazione dei Risultati MEME): Sequence Logos: Visualizzare i primi 3 motivi predetti affiancati in formato sequence logo colorato e ad alta definizione. Questo è il risultato principale dell'analisi MEME e deve essere visivamente accattivante. Annotazione: Etichettare chiaramente il valore E di MEME e la larghezza sotto ogni logo. In Basso (Risultati TOMTOM e Filtraggio): Grafico a Barre: Tracciare i primi 3-5 fattori di trascrizione candidati con la massima significatività dopo il confronto TOMTOM come grafico a barre orizzontale, utilizzando il loro -log10(p-value) corrispondente come metrica. Design: Utilizzare schemi di colori professionali (come le palette di colori viridis o Set2). Disporre le barre in ordine decrescente da sinistra a destra per valore e etichettare direttamente il nome del fattore (ad esempio, KLF5) e il p-value specifico alla fine della barra. Percorso di Filtraggio: A destra del grafico a barre, utilizzare un'icona a imbuto o un'icona di filtraggio per puntare ai 1-2 "fattori candidati principali" finali, evidenziandoli con colori diversi o marcatori a stella. Lato Destro - Area del Ponte di Validazione Sperimentale Design: Delimitare con caselle tratteggiate o sfondi di colore chiaro per indicare che questo è il passaggio successivo guidato dalla predizione. Contenuto: Illustrare brevemente i successivi esperimenti chiave di validazione con icone e testo, come ChIP-qPCR (icone di sfere magnetiche e DNA) e saggi genici reporter (icona della luciferasi), con frecce che puntano a "regolatori validati". Funzione: Questo modulo migliora notevolmente l'integrità scientifica e la profondità della figura, indicando che la ricerca va oltre la predizione computazionale e completa la validazione a circuito chiuso.