
Résumé graphique d'une étude visant à améliorer le diagnostic et la stratification du risque dans le cancer de la prostate familial grâce à l'intégration de données génomiques, épigénomiques et cliniques. Nous avons 2 individus atteints par famille, tandis que les échantillons de contrôle proviennent d'une base de données (extraction sanguine). Un séquençage du génome entier est réalisé à l'aide de la technologie Oxford Nanopore : deux couches d'informations sont obtenues simultanément à partir de la même molécule d'ADN : (1) la variation génétique (SNVs, indels et variants structuraux) et (2) la méthylation de l'ADN (sites CpG et régions régulatrices). Une caractérisation génomique et épigénomique distincte du cancer est effectuée. Par la suite, une intégration multi-omique (mQTLs) est réalisée : identification des relations fonctionnelles entre les variants génétiques et les changements dans la méthylation de l'ADN, ainsi que leur association avec les voies biologiques pertinentes du cancer de la prostate. Enfin, l'intégration des signatures moléculaires...
Un schéma illustrant l'impact du lactate sur le SNC des pati...