
Proposition de conception de figure : Organigramme intégré Titre de la figure : Stratégie computationnelle et expérimentale intégrée pour l'identification des régulateurs transcriptionnels en amont de Fgf4 Concept de conception : Intègre un "récit de processus de gauche à droite" avec une "présentation des résultats de haut en bas", fusionnant stratégie et résultats. Emploie des couleurs professionnelles, une densité d'information élevée et un guidage visuel clair. Explication détaillée et points d'amélioration pour chaque module : Côté gauche - Zone de l'organigramme de stratégie Conception : Utiliser des blocs de couleur et des flèches en niveaux de gris ou à faible saturation pour définir clairement les étapes, reflétant la méthodologie. Ajouter de petites icônes (telles qu'une double hélice d'ADN ou une loupe) à côté des étapes "Prédiction MEME" et "Comparaison TOMTOM" pour améliorer la reconnaissance. Points clés : Indiquer les paramètres clés, tels que la plage de séquences, le seuil de valeur E de MEME et le nom de la base de données utilisée. Milieu - Zone de visualisation des résultats Haut (Affichage des résultats MEME) : Logos de séquence : Afficher les 3 principaux motifs prédits côte à côte en format de logo de séquence haute définition et coloré. Il s'agit du résultat principal de l'analyse MEME et il doit être visuellement attrayant. Annotation : Indiquer clairement la valeur E de MEME et la largeur sous chaque logo. Bas (Résultats TOMTOM et filtrage) : Diagramme à barres : Tracer les 3 à 5 principaux facteurs de transcription candidats avec la plus haute signification après la comparaison TOMTOM sous forme de diagramme à barres horizontal, en utilisant leur -log10(p-value) correspondant comme métrique. Conception : Utiliser des schémas de couleurs professionnels (tels que les palettes de couleurs viridis ou Set2). Disposer les barres par ordre décroissant de gauche à droite par valeur, et étiqueter directement le nom du facteur (par exemple, KLF5) et la p-value spécifique à la fin de la barre. Chemin de filtrage : À droite du diagramme à barres, utiliser une icône d'entonnoir ou une icône de filtrage pour pointer vers les 1 à 2 "facteurs candidats principaux" finaux, en les mettant en évidence avec différentes couleurs ou des marqueurs d'étoile. Côté droit - Zone de pont de validation expérimentale Conception : Délimiter avec des boîtes en pointillés ou des arrière-plans de couleur claire pour indiquer qu'il s'agit de l'étape suivante guidée par la prédiction. Contenu : Illustrer brièvement les expériences de validation clés ultérieures avec des icônes et du texte, telles que ChIP-qPCR (icônes de billes magnétiques et d'ADN) et des tests de gènes rapporteurs (icône de luciférase), avec des flèches pointant vers les "régulateurs validés". Fonction : Ce module améliore considérablement l'intégrité scientifique et la profondeur de la figure, indiquant que la recherche va au-delà de la prédiction computationnelle et achève la validation en boucle fermée.