Générateur de graphiques d'enrichissement

Créer Générateur de graphiques d'enrichissement à partir de données expérimentales ou de recherche

Utilisez Générateur de graphiques d'enrichissement avec des données CSV ou Excel, puis affinez dans SciVis le graphique produit par Python.

Conçu pour la rechercheModifiable dans SciVisCSV, TSV, TXT et ExcelExport pour publication

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Glissez un fichier de données ici, ou cliquez pour téléverser

CSV, TSV, TXT, Excel · Max 5 Mo

Coûte 10 créditsImporter un seul fichier CSV, TSV, TXT, XLSX ou XLS (la première feuille Excel est utilisée)

Aperçu

Aperçu du Générateur de graphiques d'enrichissementExemple

Cet aperçu utilise le jeu de données choisi. Recréez-le avec Python ou importez vos propres données pour produire un nouveau graphique.

Exemples de Générateur de graphiques d'enrichissement avec données à télécharger

Ouvrez un exemple pour examiner le graphique, télécharger son CSV ou charger les mêmes données dans le générateur ci-dessus.

Que montre Générateur de graphiques d'enrichissement ?

Générateur de graphiques d'enrichissement transforme des données de recherche structurées selon la relation statistique propre à ce graphique. Il convient notamment à Enrichissement GO des processus biologiques et Enrichissement des voies KEGG ; Python crée une première version reproductible, puis SciVis assure la finition visuelle.

Données requises pour Générateur de graphiques d'enrichissement

  • Champs représentatifs : term, source, gene_ratio, gene_count, adjusted_p, neg_log10_adjusted_p.
  • Chaque ligne correspond à une observation, une catégorie, un temps ou une paire valide.
  • Les mesures restent numériques et les unités figurent dans le nom des colonnes.
  • Les cellules vides sont traitées comme manquantes ; retirez totaux et notes avant import.

Exemples de recherche pour Générateur de graphiques d'enrichissement

  • Enrichissement GO des processus biologiques
  • Enrichissement des voies KEGG
  • Score d’enrichissement cumulé GSEA
  • Enrichissement d’ontologie des maladies
  • Enrichissement de marqueurs de types cellulaires
  • Enrichissement de cibles de facteurs de transcription

Pourquoi utiliser Générateur de graphiques d'enrichissement avec des données de recherche ?

  • Vérifiez d’abord le mappage des champs avec l’exemple Enrichissement GO des processus biologiques fourni.
  • Réutilisez la structure visuelle de Enrichissement des voies KEGG pour un jeu de données comparable.
  • Profitez du rendu Python sans écrire ni déboguer vous-même le code du graphique.
  • Conservez les valeurs produites et affinez libellés, couleurs et export dans SciVis.

Comment utiliser Générateur de graphiques d'enrichissement

Choisissez un exemple ou importez un fichier CSV, TSV, TXT, XLSX ou XLS. Vérifiez les colonnes détectées, générez le graphique, puis modifiez-le dans SciVis. Pour Excel, la première feuille est importée.

Éléments d’un Générateur de graphiques d'enrichissement lisible

  • Axes, groupes ou nœuds sont mappés de façon cohérente depuis term, source, gene_ratio, gene_count, adjusted_p, neg_log10_adjusted_p.
  • Le titre précise le résultat ou la comparaison présentée par Générateur de graphiques d'enrichissement.
  • Libellés, unités, légendes et lignes de référence nécessaires restent lisibles.
  • Une palette sobre et une résolution suffisante conviennent aux articles, posters et diapositives.

Générateur de graphiques d'enrichissement ou Créateur de graphiques à bulles ?

Choisissez Générateur de graphiques d'enrichissement lorsque les colonnes et la question suivent sa structure statistique. Si l’autre comparaison est centrale, préférez Créateur de graphiques à bulles afin d’éviter un encodage visuel trompeur.

Questions fréquentes sur Générateur de graphiques d'enrichissement

Quelles colonnes faut-il pour Générateur de graphiques d'enrichissement ?

Le CSV fourni montre la structure conseillée. Les champs représentatifs sont term, source, gene_ratio, gene_count, adjusted_p, neg_log10_adjusted_p ; des noms équivalents conviennent s’ils jouent le même rôle.

Quand choisir Générateur de graphiques d'enrichissement plutôt que Créateur de graphiques à bulles ?

Utilisez Générateur de graphiques d'enrichissement pour la relation statistique qu’il est conçu à représenter. Choisissez Créateur de graphiques à bulles si son autre comparaison répond mieux à la question.

Puis-je modifier une figure après sa création avec Générateur de graphiques d'enrichissement ?

Oui. Ouvrez la figure créée avec Générateur de graphiques d'enrichissement dans SciVis pour changer libellés, couleurs, annotations, mise en page et autres réglages visuels.

Puis-je utiliser une figure Générateur de graphiques d'enrichissement dans un article scientifique ?

Oui. Générateur de graphiques d'enrichissement vise des figures scientifiques claires et prêtes à publier. Vérifiez néanmoins les valeurs et les consignes de la revue avant soumission.

Générateur de graphiques d'enrichissement permet-il un export haute résolution ?

Oui. Après retouche d’une figure Générateur de graphiques d'enrichissement dans SciVis, exportez-la pour un article, une affiche, des diapositives ou un rapport.

Faut-il savoir programmer pour utiliser Générateur de graphiques d'enrichissement ?

Non. Le parcours guidé de Générateur de graphiques d'enrichissement crée la première version ; les réglages fins se font visuellement dans SciVis.

Comment représenter vos données de recherche avec Générateur de graphiques d'enrichissement

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