Figuren Design Vorschlag: Integriertes Flussdiagramm Figurentitel: Integrierte Computergestützte und Experimentelle Strategie zur Identifizierung von Upstream-Transkriptionsregulatoren von Fgf4 Designkonzept: Integriert eine "Links-nach-Rechts-Prozessdarstellung" mit einer "Oben-nach-Unten-Ergebnispräsentation", wodurch Strategie und Ergebnisse verschmolzen werden. Verwendet professionelle Farben, hohe Informationsdichte und klare visuelle Führung. Detaillierte Erläuterung und Verbesserungspunkte für jedes Modul: Linke Seite - Strategie-Flussdiagrammbereich Design: Verwenden Sie Graustufen- oder Farbbblöcke mit geringer Sättigung und Pfeile, um die Schritte klar zu definieren und die Methodik widerzuspiegeln. Fügen Sie kleine Symbole (wie eine DNA-Doppelhelix oder eine Lupe) neben den Schritten "MEME-Vorhersage" und "TOMTOM-Vergleich" hinzu, um die Erkennung zu verbessern. Schlüsselpunkte: Geben Sie wichtige Parameter an, wie z. B. Sequenzbereich, MEME's E-Wert-Schwellenwert und den Namen der verwendeten Datenbank. Mitte - Bereich zur Ergebnisvisualisierung Oben (MEME-Ergebnisanzeige): Sequenzlogos: Zeigen Sie die vorhergesagten Top 3 Motive nebeneinander in hochauflösender, farbenfroher Sequenzlogo-Formatierung an. Dies ist das Kernergebnis der MEME-Analyse und muss optisch ansprechend sein. Annotation: Beschriften Sie den MEME-E-Wert und die Breite unter jedem Logo deutlich. Unten (TOMTOM-Ergebnisse und Filterung): Balkendiagramm: Stellen Sie die Top 3-5 Kandidaten-Transkriptionsfaktoren mit der höchsten Signifikanz nach dem TOMTOM-Vergleich als horizontales Balkendiagramm dar, wobei deren übereinstimmender -log10(p-Wert) als Metrik verwendet wird. Design: Verwenden Sie professionelle Farbschemata (wie z. B. Viridis- oder Set2-Farbpaletten). Ordnen Sie die Balken in absteigender Reihenfolge von links nach rechts nach Wert an und beschriften Sie den Faktornamen (z. B. KLF5) und den spezifischen p-Wert direkt am Ende des Balkens. Filterpfad: Verwenden Sie rechts neben dem Balkendiagramm ein Trichtersymbol oder ein Filtersymbol, um auf die endgültigen 1-2 "Kernkandidatenfaktoren" zu verweisen und diese mit unterschiedlichen Farben oder Sternmarkierungen hervorzuheben. Rechte Seite - Experimenteller Validierungs-Brückenbereich Design: Gliedern Sie diesen Bereich mit gestrichelten Kästen oder hellfarbigen Hintergründen, um anzuzeigen, dass dies der nächste Schritt ist, der durch die Vorhersage geleitet wird. Inhalt: Veranschaulichen Sie kurz nachfolgende wichtige Validierungsexperimente mit Symbolen und Text, wie z. B. ChIP-qPCR (magnetische Kügelchen und DNA-Symbole) und Reportergen-Assays (Luziferase-Symbol), mit Pfeilen, die auf "validierte Regulatoren" zeigen. Funktion: Dieses Modul verbessert die wissenschaftliche Integrität und Tiefe der Abbildung erheblich, da es anzeigt, dass die Forschung über die computergestützte Vorhersage hinausgeht und eine geschlossene Validierung abschließt.
